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Dynamique spatio-temporelle du zooplancton dans l'estuaire de la Gironde et implications au sein du réseau trophique planctonique

Dynamique spatio-temporelle du zooplancton dans l'estuaire de la Gironde et implications au sein du réseau trophique planctonique PDF Author: Valérie David (océanographe).)
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L'objectif de cette thèse est de définir le fonctionnement du réseau trophique planctonique dans l'estuaire de la Gironde. Cette étude caractérise dans un premier temps la variabilité spatio-temporelle du zooplancton pour trois échelles de temps - inter-annuelle, saisonnière et tidale - afin de définir la co-distribution des principales espèces dans l'espace et dans le temps. Sur la base de ces résultats, des suivis ciblés ont été réalisés afin de décrire le réseau trophique planctonique à l'aide de marqueurs trophiques, d'expérimentations proies-prédateurs (conditions contrôlées / in situ simulées) et d'un modèle proies-prédateurs de type Lotka-Voltera.

Dynamique spatio-temporelle du zooplancton dans l'estuaire de la Gironde et implications au sein du réseau trophique planctonique

Dynamique spatio-temporelle du zooplancton dans l'estuaire de la Gironde et implications au sein du réseau trophique planctonique PDF Author: Valérie David (océanographe).)
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L'objectif de cette thèse est de définir le fonctionnement du réseau trophique planctonique dans l'estuaire de la Gironde. Cette étude caractérise dans un premier temps la variabilité spatio-temporelle du zooplancton pour trois échelles de temps - inter-annuelle, saisonnière et tidale - afin de définir la co-distribution des principales espèces dans l'espace et dans le temps. Sur la base de ces résultats, des suivis ciblés ont été réalisés afin de décrire le réseau trophique planctonique à l'aide de marqueurs trophiques, d'expérimentations proies-prédateurs (conditions contrôlées / in situ simulées) et d'un modèle proies-prédateurs de type Lotka-Voltera.

STRUCTURE SPATIO-TEMPORELLE DU ZOOPLANCTON ET DU SUPRABENTHOS DE L'ESTUAIRE DE LA SEINE. DYNAMIQUE ET ROLE DES PRINCIPALES ESPECES DANS LA CHAINE TROPHIQUE PELAGIQUE

STRUCTURE SPATIO-TEMPORELLE DU ZOOPLANCTON ET DU SUPRABENTHOS DE L'ESTUAIRE DE LA SEINE. DYNAMIQUE ET ROLE DES PRINCIPALES ESPECES DANS LA CHAINE TROPHIQUE PELAGIQUE PDF Author: Pascal Mouny
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CETTE ETUDE, REALISEE DANS LE CADRE DU PROGRAMME SEINE-AVAL, A POUR BUT DE DRESSER UN INVENTAIRE DE LA FAUNE SUPRABENTHIQUE ET MESOZOOPLANCTONIQUE DE L'ESTUAIRE DE LA SEINE ET DE CONNAITRE LA STRUCTURE SPATIO-TEMPORELLE DES DEUX COMMUNAUTES. ELLE FOURNIT UN PREMIER APERCU AUSSI EXHAUSTIF QUE POSSIBLE DE LA FAUNE PELAGIQUE ESTUARIENNE. LES COMPOSITIONS QUALITATIVES ET QUANTITATIVES DES DIFFERENTES CATEGORIES D'ORGANISMES (MESOZOOPLANCTON ET SUPRABENTHOS) ONT ETE DECRITES LE LONG DU GRADIENT DE SALINITE ; LA ZONE OLIGOHALINE (SALINITE DE SURFACE INFERIEURE A 5,0 P.S.U.) EST CARACTERISEE PAR LES PLUS FORTES ABONDANCES MESOZOOPLANCTONIQUES ET SUPRABENTHIQUES. LE MESOZOOPLANCTON EST DOMINE PAR LE COPEPODE CALANOIDE EURYTEMORA AFFINIS DONT LA PERIODE DE DENSITE MAXIMALE EST ENREGISTREE ENTRE MARS ET JUIN. LE SUPRABENTHOS EST DOMINE PAR TROIS ESPECES : LE MYSIDACE NEOMYSIS INTEGER PRESENTANT UNE PERIODE DE REPRODUCTION DE MARS A SEPTEMBRE AVEC TROIS GENERATIONS ANNUELLES ; LE DECAPODE PALAEMON LONGIROSTRIS ET LE GOBIIDE POMATOSCHISTUS MICROPS QUI ONT UNE REPRODUCTION ESTIVALE ET UNE SEULE GENERATION ANNUELLE. LA STRUCTURE SPATIALE DES DEUX COMMUNAUTES ETUDIEES EST ESSENTIELLEMENT INFLUENCEE PAR LE GRADIENT LONGITUDINAL DE SALINITE. LE BOUCHON VASEUX N'INTERVIENT QU'INDIRECTEMENT EN JOUANT LE ROLE DE BARRIERE, LIMITANT LES DEPLACEMENTS VERS L'AVAL OU VERS L'AMONT DES DIFFERENTES ESPECES. EN REVANCHE, BIEN QUE LE DEFICIT EN OXYGENE SOIT UNE CARACTERISTIQUE DE L'ESTUAIRE DE LA SEINE, LE GRADIENT LONGITUDINAL D'OXYGENE DISSOUS NE SEMBLE PAS INTERVENIR DANS LA STRUCTURATION DES COMMUNAUTES SANS DOUTE EN RELATION AVEC LE CARACTERE TEMPORAIRE DE CE DEFICIT LIE AUX PERIODES DE MORTE EAU DANS CETTE PARTIE DE L'ESTUAIRE. LE RESEAU TROPHIQUE DE LA ZONE OLIGOHALINE EST PELAGIQUE ET ESSENTIELLEMENT CENTRE SUR LE COPEPODE DOMINANT E. AFFINIS QUI EST LA PRINCIPALE SOURCE DE NOURRITURE DES ESPECES DE CETTE PARTIE DE L'ESTUAIRE.

Analyse des variations spatio-temporelles du zooplancton gélatineux et son effet sur les flux de matières à l'aide d'une approche combinant expérimentation et écologie numérique

Analyse des variations spatio-temporelles du zooplancton gélatineux et son effet sur les flux de matières à l'aide d'une approche combinant expérimentation et écologie numérique PDF Author: Simon Ramondenc
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Le terme plancton désigne l'ensemble des organismes dérivant au grès des courants marins. On distingue le plancton végétal et principalement photosynthétique, "le phytoplancton", du plancton animal hétérotrophe, "le zooplancton". Au cours des dernières décennies, de nombreuses études ont documenté une croissance de l'abondance et de la distribution spatiale du zooplancton gélatineux à travers diverses régions. Même si le terme "gélification" des océans doit être utilisé avec beaucoup de précaution, des régions comme la mer Méditerranée montre une constante augmentation des méduses au cours de ces 40 dernières années. L'espèce Pelagia noctiluca (Forsskål, 1775) est considérée comme étant la méduse la plus abondante du bassin méditerranéen depuis les années 70. Du fait de leur présence massive dans cette région, il est primordial d'évaluer précisément l'impact de P. noctiluca à la fois sur les cycles biogéochimiques et sur la structuration des écosystèmes pélagiques. Pour cela, les deux processus majeurs de transfert de matière dans l'écosystème doivent être étudiés : la séquestration de carbone via la pompe biologique et le transfert de carbon au travers des réseaux trophiques. Cette thèse s'articule autour de trois axes majeurs: (i) réaliser un premier bilan de l'export de carbone organique particulaire (POCtotal) et dissous (DOC) en mer Méditerranée, (ii) construire un modèle écophysiologique de P. noctiluca pour déterminer la contribution de cette méduse à la pompe biologique, et (iii) évaluer le niveau trophique de P. noctiluca et son potentiel impact sur les niveaux trophiques inférieurs.

Dynamique de population, caractérisation morphologique et production secondaire d'Eurytemora affinis hirundoides, Copépode calanoïde dans l'estuaire de la Gironde

Dynamique de population, caractérisation morphologique et production secondaire d'Eurytemora affinis hirundoides, Copépode calanoïde dans l'estuaire de la Gironde PDF Author: Agnès Feurtet
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LE COPEPODE CALANOIDE EURYTEMORA AFFINIS HIRUNDOIDES CONSTITUE L'ESPECE AUTOCHTONE DOMINANTE DU ZOOPLANCTON DE L'ESTUAIRE DE LA GIRONDE. A CE TITRE, UNE CONNAISSANCE DETAILLEE DE SA DYNAMIQUE DE POPULATION ET UNE ESTIMATION PRECISE DE SA PRODUCTION SECONDAIRE SONT INDISPENSABLES A UNE MEILLEURE APPREHENSION DES FLUX DE MATIERE ORGANIQUE EXISTANT AU SEIN DES RESEAUX TROPHIQUES. LE CARACTERE HETEROGENE DE LA DISTRIBUTION SPATIO-TEMPORELLE DE L'ESPECE EST ETUDIE AU TRAVERS DE PRELEVEMENTS COLLECTES ENTRE 1984 ET 1987. IL EST INTERPRETE PRINCIPALEMENT PAR LA VARIABILITE DE CERTAINS FACTEURS DU MILIEU (SALINITE, MATIERES EN SUSPENSION, OXYGENE DISSOUS) QUI AGISSENT AUSSI SUR LA BIOMETRIE DE L'ESPECE. LA CARACTERISATION MORPHOLOGIQUE ET PONDERALE D'EURYTEMORA MENEE SUR TOUTE LA LONGUEUR DE L'ESTUAIRE PERMET AINSI D'IDENTIFIER UNE POPULATION UNIQUE, MAIS A MORPHOLOGIE VARIABLE. ENFIN, L'ESTIMATION DE LA PRODUCTION SECONDAIRE DU COPEPODE EURYTEMORA AFFINIS HIRUNDOIDES EST OBTENUE A PARTIR D'UN SUIVI DECADAIRE PRATIQUE DURANT UNE ANNEE. L'APPLICATION DE DEUX TYPES DE METHODES DE CALCUL DE CONCEPTION DIFFERENTE FOURNIT UN INTERVALLE DE VALEURS COMPRIS ENTRE 1,63 ET 4,3 GRAMMES PAR METRE CUBE ET PAR AN. L'ETUDE APPROFONDIE DE LA CINETIQUE DEMOGRAPHIQUE ET L'EXAMEN DE DIFFERENTS PARAMETRES MORPHOLOGIQUES PERMETTENT DE SUGGERER QUE LA MAJEURE PARTIE DE CETTE PRODUCTION SECONDAIRE EST PEU EXPORTEE VERS L'OCEAN, MAIS PLUTOT RECYCLEE A L'INTERIEUR DU SYSTEME ESTUARIEN.

Estuaire de la Charente

Estuaire de la Charente PDF Author: Julien Modéran
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Les estuaires sont des systèmes hautement dynamiques où interagissent des processus biogéochimiques complexes qui influent sur le devenir de la matière organique et non organique. La confrontation des eaux fluviales et marines induit des changements rapides des principaux facteurs structurant la distribution des organismes vivants et gouvernant la spéciation de certains éléments traces entre phase particulaire et dissoute, ex : gradient de salinité, teneurs en matières en suspension (MES). Ce travail vise à étudier l'estuaire de la Charente, principal fleuve influançant le bassin de Marennes-Oléron (première zone ostreicole française) afin (i) de caractériser la structure de la communauté zooplanctonique en relation avec les paramètres environnementaux, (ii) le fonctionnement de la base du réseau trophique de l'estuaire (identification des sources de matière organique exploitée par les organismes zooplanctoniques et suprabenthiques) et (iii) d'établir un état de contamination par les métaux des compartiments biotiques. L'estuaire de la Charente se distingue par des concentrations en MES extrêmement élevées, présentant néanmoins une contribution importante de la matière organique (efflorescence phytoplanctonique printanière en zone mésohaline et production microphytobenthique). La zone de turbidité maximale semble correspondre à un écotone qui contrôle les flux de matière organique et la distribution des organismes. Le mélange physique des particules issues des systèmes dulcicoles et marins adjacents à l'estuaire avec cette forte charge de matériel resuspendu conduit à une homogénéisation des signatures isotopiques et métalliques particulaires en été et automne le long du gradient de salinité. Les quatre assemblages zooplanctoniques identifiés sont structurés spatialement par la salinité et la concentration en MES et temporellement par les variations de température et de débit fluvial. Malgré la dominance quantitative du matériel détritique au sein du pool de matière organique particulaire (MOP), il semble que les 5 taxons planctoniques ou suprabenthiques dominants étudiés (Eurytemora affinis, Acartia spp., Daphnia spp., Neomysis integer, Mesopodopsis slabberi) présentent une sélectivité importante vis-à-vis de sources primaires distinctes. Cette succession spatio-temporelle d'espèces sélectives conduit à une multiplication des flux trophiques et semble ainsi optimiser à l'échelle annuelle l'exploitation de la MOP disponible. Les concentrations en Cd, Cu, Hg, Pb, V et Zn ont par ailleurs été mesurées dans près de 40 taxons estuariens (zooplancton, benthos, poissons). Malgré des concentrations en métaux dissous et particulaires plus faibles que dans les grands estuaires européens subissant une pression anthropique importante (Seine, Gironde), les niveaux de contamination mesurés dans les différents compartiments biotiques semblent globalement équivalents. Les évènements brefs (crue hivernale, efflorescence phytoplanctonique printanière) altèrent toutefois fortement ce schéma général en modifiant les sources primaires de matière organique disponibles et les concentrations métalliques particulaires (Cd notamment).

Structure spatio-temporelle du zooplancton lacustre

Structure spatio-temporelle du zooplancton lacustre PDF Author:
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Une meilleure compréhension des mécanismes régissant la distribution spatio-temporelle du zooplancton lacustre a des répercussions profondes en écologie. Les sujets explorés réfèrent au partage de la contribution des facteurs biotiques versus abiotiques, à une approche par groupes de taille et à un suivi temporel étendu. L'hypothèse était que le zooplancton d'une baie au lac Memphrémagog (Québec), suivra un patron cyclique de distribution spatio-temporelle influencé par des facteurs biotiques (planctonivores, ressources) et par des facteurs abiotiques (courants et physico-chimie). Les objectifs étaient (1) identifier et décrire la structure spatiale horizontale du zooplancton, (2) suivre son évolution temporelle, (3) séparer l'apport des variables biotiques vs variables abiotiques et (4) explorer les patrons verticaux. Les variables (densité de zooplancton, courants, biomasse de chlorophylle, température, DO, pH, turbidité et planctonivores) ont été échantillonnés sur un transect horizontal répété dans le temps (aux 6 heures, aux mois). À cela s'ajoutaient deux traits verticaux de zooplancton. La structure spatiale varie dans le temps (jour et saison). La densité de prédateurs, la disponibilité des ressources et les courants ont expliqué jusqu'à 60% de la variation de la structure spatiale du zooplancton selon l'échelle utilisée et le temps, reflétant les cycles biologiques et les évènements de courants. La prédation est une variable commune entre la structure spatiale horizontale et verticale du zooplancton. Le zooplancton (>750 æm) adopte la migration verticale journalière inverse en réponse à la prédation. Ce travail est en accord avec l'hypothèse des forces motrices multiples. Le partage contribution biotiques vs abiotiques est mis en évidence par décomposition des échelles spatiales. Il serait important d'intégrer la dynamique temporelle de la structure spatiale du zooplancton aux théories écologiques et à la planification d'échantillonnage. L'approche par grou.

Distribution spatio-temporelle du zooplancton dans un lac eutrophe

Distribution spatio-temporelle du zooplancton dans un lac eutrophe PDF Author: Hassan Taleb
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Pages : 269

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Dynamique et distribution spatio-temporelle des communautés zooplanctonique et micro-nectonique

Dynamique et distribution spatio-temporelle des communautés zooplanctonique et micro-nectonique PDF Author: raphaël Girardin
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Pages : 39

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Les connaissances acquises par l'observation in situ et la modélisation sur les compartiments trophiques souffrent d'une profonde carence au niveau de l'échelon intermédiaire. Dans cette étude, nous étudions localement la distribution spatio-temporelle du zooplancton et du micro-necton à partir de données acoustiques bi et multi-fréquences (38, 70, 120 et 200 kHz) en l'absence d'échantillonnages biologiques. Les données traitées ont été acquises lors de campagnes et d'un transit dans l'océan Indien. Le but de cette étude est d'apporter des connaissances supplémentaires sur le compartiment trophique intermédiaire afin de pouvoir les intégrer au modèle End to End. La méthodologie repose sur l'écho-intégration par couche et l'utilisation des méthodologies de traitement de données multi-fréquentielles développées ces dernières années. Les techniques d'analyses bi-fréquentielles et les procédés d'inversions, nous ont permis de discriminer le zooplancton et le micro-necton par groupe d'organismes ayant les mêmes caractéristiques acoustiques. A partir de ces observations, nous pouvons étudier la répartition en classe de taille et l'abondance relative de ces groupes. Il ressort de cette étude une dominance des organismes présentant une inclusion gazeuse dans toute la couche épipélagique de notre zone d'étude. L'intérieur du canal du Mozambique est plus riche et a une couche méso-pélagique moins profonde qu'à l'extérieur. Les organismes sont plus grands dans la couche épipélagique au sein du canal. De plus, cette étude a aussi révélé que 90% de la densité acoustique de la couche épipélagique se situe dans la zone euphotique. Enfin, les données issues des transits (ou de campagne sans échantillonnage biologique) sont une source d'information peu onéreuse et exploitable. Nos résultats permettent de valider et de perfectionner le modèle APECOSM.

Cinétique et rôle du zooplancton dans les flux de matière particulaire

Cinétique et rôle du zooplancton dans les flux de matière particulaire PDF Author: Maïa Ter Ovanessian-Akopian
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L'etude du peuplement planctonique a une large echelle geographique du reseau hydrographique de la seine a ete realisee dans le cadre du programme piren-seine (cnrs), d'un programme europeen binoculars (dgxii) et du programme seine-aval, pilote par l'ifremer (contrat de plan etat-region de haute-normandie) : tout au long d'un continuum riviere-reservoir-riviere-estuaire. Le zooplancton de la riviere en amont du reservoir est constitue en majorite d'organismes de petite taille avec une forte proportion d'especes benthiques a cycle de vie bref en relation avec le temps de residence des eaux court. Dans le reservoir marne (48 km 2 en derivation sur la riviere du meme nom), nous observons une forte heterogeneite spatiale, tant horizontale que verticale, et surtout temporelle avec de fortes variations saisonnieres de la biomasse, de la taille moyenne individuelle et de la composition du peuplement. Il decoule des etudes menees sur le reservoir que les deux bassins qui le composent, separes par la digue de champaubert, ont des caracteres morphologiques, hydrologiques et ecologiques particuliers : le petit bassin (ou lac de champaubert), moins profond est nettement plus productif avec une biomasse algale et une densite zooplanctonique superieures a celles du grand bassin, plus profond et stratifie en ete. L'instabilite des conditions dans le petit lac-amont favorise la dominance des petites especes a reproduction rapide (strategie r). La proportion des grands filtreurs (tels que daphnia spp.) augmente vers l'aval du reservoir, ou les fluctuations physico-chimiques sont moindres. La communaute zooplanctonique du reservoir, exportee dans la riviere, est amputee des grands organismes par la predation des alevins de poissons. La faible biomasse du zooplancton compose de petits especes, n'a pas un fort impact sur le phytoplancton de la riviere. Il en va autrement des (dreissena polymorpha), mollusques benthiques a l'etat adulte, mais planctonique au stade larvaire, dont le role semble avoir ete passablement sous-estime, jusqu'a present. La principale difficulte reside dans la meconnaissance du stock d'adultes. Nous avons utilise une methode d'estimation de ce stock a partir des flux larvaires. Le stock estime par cette methode est conforme aux observations des colonies d'adultes dans la seine. Le flux planctonique augmente de l'amont vers l'aval et atteint son maximum dans l'estuaire, dont l'hydrologie particuliere conduit a un allongement de temps de sejour des eaux. Les especes dominantes dans la partie fluviale de l'estuaire sont indicatrices de l'eutrophie du milieu. L'impact du zooplancton parait significatif sur la fraction consommable du phytoplancton, favorisant le developpement des algues de grande taille. La pression des dreissenes (larves et adultes), localisees principalement dans l'estuaire moyen, semble beaucoup plus elevee que celle du zooplancton. Dans l'embouchure, les taxons dulcaquicoles stricts sont progressivement remplaces par des especes supportant l'accroissement de la salinite. Plus en aval, ce microzooplancton meurt par suite d'un choc osmotique.

Ecologie des communautés zooplanctoniques au sein de deux écosystèmes littoraux méditerranéens

Ecologie des communautés zooplanctoniques au sein de deux écosystèmes littoraux méditerranéens PDF Author: Benjamim Bandeira
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Ce travail a porté sur l'étude de l'évolution des communautés zooplanctoniques à partir de séries temporelles de relevés effectués de 1995 à 2010 dans deux écosystèmes côtiers couplés, la Petite Rade de Toulon (PR) et Grande Rade de Toulon (GR) (Méditerranée Nord Occidentale, France) en relation avec les facteurs climatiques, les paramètres physiques et chimiques de l'eau et avec le phytoplancton. Le pas d'échantillonnage des relevés de zooplancton et du phytoplancton était d'un mois en moyenne. La maille du filet utilisé était de 90 μm, afin de cibler le mésozooplancton. La PR a différé de la GR dans son fonctionnement écologique, car elle est semi-fermée, mais aussi parce que l'activité anthropique y était beaucoup plus importante. Nos résultats ont montré que, de 1995 à 2010 dans les deux baies, l'abondance du zooplancton a sensiblement augmenté, surtout dans la PR. Il a été également établi, en utilisant différents outils statistiques, que la plus grande partie des espèces de zooplancton évolue de manière coordonnée chaque année, mais d'une manière différente d'une année à l'autre. C'est ce que nous avons appelé la signature annuelle, qui était très marquée dans la PR. Plusieurs paramètres environnementaux comme la température, l'oxygène, la salinité et l'ensoleillement, qui ont été simultanément enregistrés, expliquent cette signature annuelle. Il a été montré en effet qu'ils influencent très sensiblement la population de zooplancton, de manière instantanée ou avec un effet retardé. Les interactions responsables de cette évolution sont fort complexes, mais il a été aussi établi que ces facteurs sont plus forts lorsqu'ils agissaient de manière coordonnée. La répartition du zooplancton en groupes taxonomiques a montré que la diversité a augmenté jusqu'en 2005, puis a diminué légèrement, tout en restant à des niveaux plus élevés qu'en 1995. L'étude détaillée de la diversité, avec une classification des indices eux-mêmes, a fait l'objet du dernier chapitre. Enfin, nous émettons l'hypothèse que la diminution des stocks de poissons au cours des dernières décennies dans toute la région a entraîné une diminution des taux de prédation sur les communautés zooplanctoniques, ce qui peut expliquer l'augmentation de peuplements zooplanctoniques au cours de ces dernières années. Cet accroissement de l'abondance du zooplancton a pu entraîner à son tour une diminution de la biomasse du phytoplancton. Cette diminution a été parallèlement observée par notre équipe. Ceci suggère un système de contrôle top-down du réseau trophique.