Variabilité des traits d'histoire de vie de poissons d'eau douce Européens à différentes échelles spatiales et niveaux biologiques PDF Download
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Book Description
Un objectif récurrent en écologie concerne la connaissance des traits d’histoire de vie et de leur variabilité. En eau douce, les contraintes environnementales sont omniprésentes pour les poissons et jouent un rôle important dans la variabilité des traits d’histoire de vie des organismes. Dans ce cadre, l’objectif principal de cette thèse consiste à étudier les liens entre les traits des poissons d’eau douce européens et l’environnement en privilégient une approche à plusieurs niveaux biologiques (population et espèce) et échelles spatiales (continentale, régionale et locale). Grâce à une importante somme de données biologiques et environnementales acquises à la fois par une vaste recherche bibliographique à l’échelle de l’Europe et un important travail de terrain sur le bassin Rhodanien, ce travail illustre (1) un effet de la température à l’échelle continentale et régionale sur plusieurs traits de populations, qui ne se confirme cependant pas pour toutes les espèces et (2) un effet très faible de l’hydraulique à l’échelle continentale et régionale sur les traits des populations. A l’opposé, au niveau de l’espèce, les relations entre les traits et l’hydraulique semblent prédominer sur les relations entre les traits et la température. L’hydraulique à l’échelle du micro-habitat joue un rôle d’ "habitat template" pour les stratégies des espèces, les milieux peu profonds et rapides sélectionnant les espèces à stratégie démographique opportuniste. La comparaison entre la variabilité intraspécifique et la variabilité interspécifique des traits illustre la pertinence d’utiliser dans les approches comparatives interspécifiques et inter-communautés des traits d’espèces mesurés à l’échelle régionale et des traits d’espèces issus de la littérature comme la fécondité et les traits liés à la taille, et cela malgré leur variabilité intraspécifique. En intégrant la variabilité de nombreux traits à plusieurs niveaux biologiques et échelles spatiales, ma thèse apporte des éléments de réflexion aux écologues de différentes disciplines telles que la dynamique et la biologie des populations, la biologie des espèces, l’écologie des communautés et l’écologie évolutive
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Un objectif récurrent en écologie concerne la connaissance des traits d’histoire de vie et de leur variabilité. En eau douce, les contraintes environnementales sont omniprésentes pour les poissons et jouent un rôle important dans la variabilité des traits d’histoire de vie des organismes. Dans ce cadre, l’objectif principal de cette thèse consiste à étudier les liens entre les traits des poissons d’eau douce européens et l’environnement en privilégient une approche à plusieurs niveaux biologiques (population et espèce) et échelles spatiales (continentale, régionale et locale). Grâce à une importante somme de données biologiques et environnementales acquises à la fois par une vaste recherche bibliographique à l’échelle de l’Europe et un important travail de terrain sur le bassin Rhodanien, ce travail illustre (1) un effet de la température à l’échelle continentale et régionale sur plusieurs traits de populations, qui ne se confirme cependant pas pour toutes les espèces et (2) un effet très faible de l’hydraulique à l’échelle continentale et régionale sur les traits des populations. A l’opposé, au niveau de l’espèce, les relations entre les traits et l’hydraulique semblent prédominer sur les relations entre les traits et la température. L’hydraulique à l’échelle du micro-habitat joue un rôle d’ "habitat template" pour les stratégies des espèces, les milieux peu profonds et rapides sélectionnant les espèces à stratégie démographique opportuniste. La comparaison entre la variabilité intraspécifique et la variabilité interspécifique des traits illustre la pertinence d’utiliser dans les approches comparatives interspécifiques et inter-communautés des traits d’espèces mesurés à l’échelle régionale et des traits d’espèces issus de la littérature comme la fécondité et les traits liés à la taille, et cela malgré leur variabilité intraspécifique. En intégrant la variabilité de nombreux traits à plusieurs niveaux biologiques et échelles spatiales, ma thèse apporte des éléments de réflexion aux écologues de différentes disciplines telles que la dynamique et la biologie des populations, la biologie des espèces, l’écologie des communautés et l’écologie évolutive
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Bien que les espèces non natives de poissons d'eau douce soient bien identifiées, les facteurs déterminant leur distribution spatiale ainsi que leurs impacts sur la biodiversité sont encore peu connus, en particulier à de larges échelles spatiales. Dans ce contexte, cette thèse vise : (i) à une meilleure compréhension de l'impact des espèces non natives de poissons d'eau douce sur les espèces natives ; et (ii) à identifier les facteurs qui contrôlent la distribution spatiale des espèces non natives. Pour cela, différents niveaux de perception du processus d'introduction d'espèces et différentes échelles spatiales ont été considérés. Les résultats obtenus à l'échelle locale (135 stations au sein d'un bassin hydrographique de Nouvelle Zélande) ont permis de mettre en évidence que l'impact d'une espèce invasive (la truite, Salmo trutta L.) sur une espèce native (Galaxias anomalus Stockell) peut varier spatialement en fonction des caractéristiques abiotiques locales. En particulier, les perturbations anthropiques, telles que la modification des habitats résultant des variations de débit, ne favorisent pas forcément les espèces invasives. Ainsi, la conservation d'une espèce native menacée nécessite des mesures de gestion adaptées au contexte environnemental local. Enfin, une étude expérimentale souligne le fait qu'une espèce considérée à priori comme invasive et nuisible (le poisson chat, Ameiurus melas Raff.) doit faire l'objet d'études quant à son impact réel sur les espèces natives ; ceci afin de mettre en place des mesures de gestion adaptées aux caractéristiques comportementales et écologiques de l'espèce impactée. Les résultats obtenus à l'échelle régionale (bassin hydrographique) montrent que les introductions d'espèces de poissons d'eau douce en Europe ont conduit à une augmentation de la diversité alpha des bassins hydrographiques (c'est-à-dire une augmentation du pool régional d'espèces), mais ont provoqué une diminution de la diversité beta (homogénéisation taxonomique). L'augmentation du pool régional de poissons d'eau douce en Europe ne doit pas forcément être interprétée comme bénéfique pour la biodiversité, car les extinctions d'espèces se déroulent généralement à des échelles de temps plus grandes que le phénomène d'introduction d'espèces...
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Pendant longtemps, la biodiversité était caractérisée uniquement par sa diversité taxonomique, c'est-à-dire par le nombre et la composition en espèces des assemblages. Cependant, de récentes études montrent que la biodiversité ne peut être résumée uniquement à cette composante, car elle ne prend pas en compte les caractéristiques écologiques des espèces. Pour cela, la diversité fonctionnelle est un outil permettant de considérer les traits fonctionnels des espèces. Peu d'études à larges échelles ont décrit cette facette de la biodiversité et son lien avec la diversité taxonomique. L'objectif de cette thèse est donc de 1) décrire et comprendre la distribution de la diversité fonctionnelle des assemblages de poissons d'eau douce à l'échelle globale et de 2) quantifier les conséquences des activités humaines sur cette facette. Pour cela, nous avons construit une base de données de traits fonctionnels de plus de 9000 espèces de poissons d'eau douce. Nous avons mis en évidence que la diversité fonctionnelle mondiale est distribuée de façon très hétérogène. Elle est essentiellement concentrée dans les bassins Néotropicaux, contrastant avec des zones taxonomiquement riches mais fonctionnellement redondantes comme l'Afrique ou l'Asie. Ces patrons pouvaient être expliqués par une diversification fonctionnelle de certains ordres de poissons Néotropicaux. À l'échelle des bassins versants, nous avons montré une faible, mais significative, influence des variables environnementales en particulier des variables historiques pour expliquer l'hétérogénéité des patrons de diversité fonctionnel des bassins versants. Nous avons également montré que les activités humaines, sous l'effet des introductions d'espèces, ont contribué à modifier considérablement les patrons de diversité fonctionnelle par rapport aux changements de diversité taxonomique. Ces changements mettent en évidence la nécessité de prendre en compte les conséquences des espèces non-natives sur le fonctionnement des écosystèmes. Dans ce travail de thèse, nous avons ainsi démontré que la diversité fonctionnelle est une facette complémentaire à la diversité taxonomique chez des poissons d'eau douce. Ces résultats contribuent à enrichir les connaissances de la structure des assemblages et peuvent avoir des implications en termes de gestion de la biodiversité.
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L’effet attendu des variations environnementales sur la biologie des poissons peut varier selon les espèces et selon leurs traits d’histoire de vie. De même, les conséquences des changements globaux n’étant pas les mêmes selon la latitude, différentes populations d’une même espèce pourront être affectées différemment selon leur localisation. Durant cette thèse, nous avons étudié l’impact des variations environnementales sur une sélection d’espèces présentes au large des côtes françaises. Une comparaison inter-espèces et inter-zones a été réalisée. Des modèles monospécifiques d’habitat ont été réalisés sur différentes populations du golfe de Gascogne et de mer Celtique afin d’établir leurs préférences pour certaines conditions de profondeur, température et salinité, et l’impact des variations environnementales sur la distribution de ces populations a été étudié. Des analyses multivariées ont permis de compléter cette étude en observant la variabilité de la distribution à l’échelle des communautés. Les espèces sélectionnées (merlu, merlan, merlan bleu, tacaud commun, petit tacaud, grondin rouge, cardine et petite roussette) montrent de fortes préférences pour des conditions particulières de profondeur, mais ne sélectionnent pas, ou rarement, des conditions particulières de température ou de salinité. De fait, les variations de ces paramètres n’ont que peu d’effet sur la distribution des populations. Par contre pour certaines espèces telle que le grondin rouge, la petite roussette ou le merlan bleu, cette distribution est affectée par des effets densité-dépendants.
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L'augmentation de la température des eaux continentales suite à un réchauffement climatique provoquera probablement des changements de traits d'histoire de vie et de distribution géographique des poissons dulçaquicoles. Dans cette étude, l'hypothèse d'un lien entre les traits d'histoire de vie et les variables environnementales (et plus particulièrement la température) a été testée grâce à des comparaisons inter-sites à l'intérieur d'une population de chabots (Cottus gobio, espèce benthique colonisant préférentiellement des eaux froides) présentant une structuration spatiale marquée. Nos résultats démontrent qu'une augmentation modérée de température (3 degrés, ce qui correspond aux changements thermiques prédits par les scénarii IPCC) sur des populations de chabots spatialement structurées affecteraient fortement leurs traits d'histoire de vie, leur structure en âges et leur densité. Des suivis à long terme sur le terrain ainsi que des études expérimentales complémentaires sont toutefois nécessaires pour confirmer ces conclusions
Author: Quentin Petitjean Publisher: ISBN: Category : Languages : en Pages : 284
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Dans le milieu naturel, les poissons sont exposés à une multitude de facteurs de stress biotiques et abiotiques, mais leurs interactions sont encore mal connues. La hausse des températures et la contamination par les éléments trace métalliques (ETMs) sont des sources importantes de stress pour les poissons. Les parasites ont également des effets sur la physiologie de leur hôte, mais sont rarement considérés en tant que facteurs de stress. Ces trois facteurs de stress agissent via des voies physiologiques communes (immunité, stress oxydant, métabolisme) et sont donc susceptibles d'interagir de manière complexe (e.g. antagonisme, synergisme). De plus, il existe souvent une grande variabilité des réponses entre échelles biologiques, des molécules aux populations. Notamment, l'historique d'exposition des populations de poisson dans leur milieu naturel pourrait conditionner leur capacité de réponse au stress. La prise en compte de ces deux niveaux de variabilité (i.e. interactions entre stress et entre échelles d'organisation) représente donc un verrou scientifique majeur pour mieux comprendre les effets des stress multiples sur les populations de poissons d'eau douce. Cette thèse vise donc à évaluer les effets combinés de facteurs de stress abiotique (i.e. température, ETMs) et biotique (i.e. challenge immunitaire provoqué par le parasitisme) sur les réponses des poissons d'eau douce via une approche multi-échelles. Afin de remplir ces objectifs, le Goujon (Gobio occitaniae) a été utilisé comme espèce modèle dans le cadre de trois approches méthodologiques : (i) une approche transversale de terrain visant à comparer l'état de santé de population de poissons le long des gradients de stress ; puis, (ii) des expérimentations en conditions contrôlées afin de distinguer les effets des différents facteurs de stress simples dans différentes populations sauvages ; enfin (iii) une expérience de translocation réciproque (i.e. encagement sur le terrain) entre sites contaminés et peu contaminés afin de tester l'adaptation locale des populations. Les résultats montrent que les stress simples ont des effets importants aux échelles biologiques fines et induisent la mise en place de stratégies métaboliques de compensation : les poissons investissent dans les défenses immunitaires et antioxydantes, avec une réduction des réserves énergétiques. De plus, les ajustements comportementaux (i.e. activité de nage, recherche de nourriture) sont particulièrement importants sous stress simples, et permettent d'ajuster l'acquisition d'énergie ce qui limite les effets sur la survie et la croissance. Au contraire, les stress multiples ont peu d'effets aux échelles moléculaires et cellulaires, mais provoquent des réponses complexes à l'échelle individuelle, ce qui se traduit par des effets antagonistes sur le comportement et des effets négatifs sur la survie et la croissance. Ces résultats suggèrent que sous stress multiples, les capacités de réponse des poissons pourraient être dépassées, menant ainsi à une stratégie de conservation, avec des effets délétères sur la fitness. Cependant, les réponses observées étaient fortement variables selon la population considérée. [...].
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Le réchauffement climatique a des conséquences sur la phénologie, les aires de répartition et la taille des organismes. Cependant, les processus physiologiques sous-jacents à ces phénomènes restent peu connus. Les ectothermes dont le métabolisme est positivement corrélé à la température pourraient montrer, sous réchauffement climatique, une production accrue d'espèces réactives de l'oxygène (ERO). Ces ERO ont été depuis quelques décennies définis comme l'un des mécanismes physiologiques sous-jacents aux stratégies d'histoire de vie. Dans cette thèse, nous avons exploré la physiologie oxydative de poissons dans des contextes thermiques variés et ses conséquences sur la gestion des traits d'histoire de vie. Nos approches expérimentales et de terrains menées sur Oryzias latipes, Perca fluviatilis & Rutilus rutilus, nous ont permis de montrer ces liens. Ces résultats sont à compléter, notamment sur le terrain où de nombreux effets confondants ont rendu les conclusions difficiles.
Author: Louis Agassiz Publisher: ISBN: 9782329774619 Category : Languages : fr Pages : 148
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Histoire naturelle des poissons d'eau douce de l'Europe centrale: planches / par Ls Agassiz Date de l'édition originale: 1839 Le présent ouvrage s'inscrit dans une politique de conservation patrimoniale des ouvrages de la littérature Française mise en place avec la BNF. HACHETTE LIVRE et la BNF proposent ainsi un catalogue de titres indisponibles, la BNF ayant numérisé ces oeuvres et HACHETTE LIVRE les imprimant à la demande. Certains de ces ouvrages reflètent des courants de pensée caractéristiques de leur époque, mais qui seraient aujourd'hui jugés condamnables. Ils n'en appartiennent pas moins à l'histoire des idées en France et sont susceptibles de présenter un intérêt scientifique ou historique. Le sens de notre démarche éditoriale consiste ainsi à permettre l'accès à ces oeuvres sans pour autant que nous en cautionnions en aucune façon le contenu. Pour plus d'informations, rendez-vous sur www.hachettebnf.fr
Author: Aurélie Blanck
Author: Aurélie Blanck
Author: Fabien Leprieur
Author: Aurèle Toussaint
Author: Cécile Persohn
Author: Asghar Abdoli
Author: Julien April
Author: Quentin Petitjean
Author: Claire Hemmer-Brepson
Author: Louis Agassiz
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