Structure génétique des populations de poissons dans l'Atlantique Nord-Est PDF Download
Are you looking for read ebook online? Search for your book and save it on your Kindle device, PC, phones or tablets. Download Structure génétique des populations de poissons dans l'Atlantique Nord-Est PDF full book. Access full book title Structure génétique des populations de poissons dans l'Atlantique Nord-Est by Grégory Charrier. Download full books in PDF and EPUB format.
Book Description
Afin d'explorer les mécanismes de structuration génétique des poissons dans l'Atlantique Nord Est, quatre espèces ont été étudiées en parallèle : merlan, lieu jaune, baudroie blanche et baudroie noire. D'une part, l'étude de la diversité mitochondriale, au niveau de l'extrémité 5'de la région de contrôle, a montré l'impact des évènements anciens sur la diversité génétique actuelle des baudroies, avec notamment, une expansion démographique rapide semblant s'être déroulée au cours de la première moitié du Pléistocène. Une différenciation génétique a été observée entre les populations atlantique et méditerranéenne seulement chez la baudroie noire et cela pourrait être dû (i) à l'impact de phénomènes de vicariance anciens et (ii) à une limitation actuelle des flux géniques par le front Alméria-Oran. L'absence de différenciation génétique chez la baudroie blanche entre la Méditerranée et l'Atlantique suggère une (re)colonisation plus récente de la Méditerranée par ce taxon. D'autre part, l'utilisation de microsatellites a souligné l'influence de facteurs hydroclimatiques actuels sur la structure génétique du lieu jaune et du merlan. La différenciation génétique significative observée chez le merlan en Mer du Nord et entre le sud du Golfe de Gascogne et les Iles Britanniques, ainsi que la structure détectée chez le lieu jaune entre la Manche Ouest—Mer d'Iroise et le Golfe de Gascogne, semblent liées à des systèmes de rétention limitant la dispersion passive des œufs et larves pélagiques. De plus, la structure des populations de merlan semble liée à un comportement de " homing " acquis. Enfin, la fragmentation de l'habitat du lieu jaune apparaît peu structurante
Book Description
Afin d'explorer les mécanismes de structuration génétique des poissons dans l'Atlantique Nord Est, quatre espèces ont été étudiées en parallèle : merlan, lieu jaune, baudroie blanche et baudroie noire. D'une part, l'étude de la diversité mitochondriale, au niveau de l'extrémité 5'de la région de contrôle, a montré l'impact des évènements anciens sur la diversité génétique actuelle des baudroies, avec notamment, une expansion démographique rapide semblant s'être déroulée au cours de la première moitié du Pléistocène. Une différenciation génétique a été observée entre les populations atlantique et méditerranéenne seulement chez la baudroie noire et cela pourrait être dû (i) à l'impact de phénomènes de vicariance anciens et (ii) à une limitation actuelle des flux géniques par le front Alméria-Oran. L'absence de différenciation génétique chez la baudroie blanche entre la Méditerranée et l'Atlantique suggère une (re)colonisation plus récente de la Méditerranée par ce taxon. D'autre part, l'utilisation de microsatellites a souligné l'influence de facteurs hydroclimatiques actuels sur la structure génétique du lieu jaune et du merlan. La différenciation génétique significative observée chez le merlan en Mer du Nord et entre le sud du Golfe de Gascogne et les Iles Britanniques, ainsi que la structure détectée chez le lieu jaune entre la Manche Ouest—Mer d'Iroise et le Golfe de Gascogne, semblent liées à des systèmes de rétention limitant la dispersion passive des œufs et larves pélagiques. De plus, la structure des populations de merlan semble liée à un comportement de " homing " acquis. Enfin, la fragmentation de l'habitat du lieu jaune apparaît peu structurante
Author: Nicolas Pédron Publisher: ISBN: Category : Languages : fr Pages : 0
Book Description
Le flet européen (Platichthys flesus) est un poisson catadrome dont l'aire de répartition dans le Nord-Est Atlantique s'étend du cercle polaire Arctique jusqu'au Portugal. Depuis quelques décennies, la limite Sud de son aire de distribution remonte le long des côtes Portugaises. Une étude préliminaire sur la biologie des populations de flet a identifié un métabolisme énergétique spécifique pour une population périphérique Sud au Portugal vs des populations situées dans le Golfe de Gascogne et en Manche. Dans la présente étude, nous avons combiné une approche en génétique de populations avec des challenges expérimentaux menés en situation de common garden, pour approfondir nos connaissances sur la différentiation génétique entre les populations de flets sur la façade Atlantique et sur le possible différentiel phénotypique qui pourrait en résulter, particulièrement en terme de bioénergétique et de traits d'histoire de vie. L'approche génétique considérant le polymorphisme de marqueurs de type microsatellites et de différents gènes candidats met en évidence une différentiation génétique très significative entre les populations de la Péninsule Ibérique et celles situées plus au Nord. Une pression de sélection différentielle s'exerce probablement sur un gène impliqué dans le métabolisme énergétique (GAPDH) et confirme la particularité génétique des populations Ibériques. Un challenge thermique et hypoxique conduit sur des poissons juvéniles et mettant en oeuvre une combinaison d'approches ciblées (activités enzymatiques sur des proxies du métabolisme énergétique en aérobiose vs anaérobiose, et de l'anabolisme) et sans a priori (protéomique par électrophorèse 2D) suggère une meilleure aptitude des populations centrales (Canche et Vilaine, France) et de la population périphérique (Lima, Portugal) à se maintenir respectivement en conditions froide vs chaude et hypoxique. Enfin, l'analyse de normes de réaction des traits de vie pour des stades embryo-larvaires exposés à un gradient thermique met en évidence une probable adaptation locale des populations de flet à leur environnement thermique.
Author: Charles Perrier Publisher: ISBN: Category : Languages : fr Pages : 198
Book Description
Cette thèse étudie la distribution spatiale de la diversité génétique des populations françaises de saumon Atlantique, s’intéressant notamment à l’effet de facteurs environnementaux et des repeuplements. 1739 individus échantillonnés dans 34 rivières françaises et provenant de cohortes anciennes (à partir 1965) et récentes ont été génotypés à 17 marqueurs microsatellites. Les résultats montrent l’existence de cinq groupes de populations génétiquement et géographiquement distincts. La distance côtière entre les populations ainsi que la longueur des rivières expliquent largement la structure observée. La grande taille des poissons adultes de l’Allier, ainsi que la différenciation importante de cette population inféodée à des sites de frais très éloignés de la mer suggèrent une adaptation locale à la difficulté de montaison. La comparaison des échantillons anciens et récents montre des taux d’introgression variables par les souches utilisées pour les repeuplements. Dans certaines rivières dépeuplées et non sujettes au repeuplement, nous avons observé des recolonisations spontanées par des poissons provenant de stocks voisins ou distants. Afin de quantifier l’impact des repeuplements dans les populations de la baie du Mont-Saint-Michel, nous avons développé des simulations individus centrées dont les résultats suggèrent une faible survie des poissons déversés. Enfin, nous avons également réalisé des analyses microchimiques sur les otolithes d’individus issus de populations repeuplées. Le couplage des analyses microchimiques et génétiques a permis de déterminer si les poissons ayant des caractéristiques génétiques de pisciculture provenaient de repeuplement ou de reproduction in natura de poissons précédemment déversés.
Author: Mohamed Hichem Kara Publisher: John Wiley & Sons ISBN: 1119618150 Category : Nature Languages : en Pages : 306
Book Description
Based on the most recent scientific data, and without neglecting historical publications, Fishes in Lagoons and Estuaries in the Mediterranean 3 comprehensively details Mediterranean lagoonal–marine migratory fish. It provides information regarding their systematics, ecobiology, ethology, genetics and their exploitation. This volume, third in a set of books on Mediterranean ichthyofauna, offers a synthesis of the knowledge acquired from 1890 to the present day for each of the 21 species most frequently found in Mediterranean lagoons and estuaries. These species are detailed across two volumes, 3A and 3B. The scientific data presented in this book concern their lagoon life as much as their marine life, and are therefore of particular interest for both the management of fish stocks and for the conservation of species. Designed to give rapid and comprehensive access to the body of knowledge on Mediterranean lagoonal and estuarine migratory fishes, this volume is for anyone involved in the use, management or protection of natural environments and their populations, including ecobiologists, geographers, engineers, teachers, students and researchers.
Book Description
Au cours des années 70-80 la pêche connaît une crise grave ; les professionnels français chalutent plus profond (1400m) à l'ouest des îles britanniques. Des pêcheries étrangères plus anciennes ont montrées la fragilité de cette ressource. Des campagnes de pêche ont permis de recenser 54 à 86 taxons. Les populations de poissons profonds sont organisées en peuplements selon la profondeur et la latitude, avec 1 a 3 espèces dominantes, le grenadier y est majoritaire. De fortes longévités ont été déterminées : 38 ans pour Alepocephalus bairdii, 54 pour Coryphaenoides rupestris et 43 pour Helicolenus dactylopterus. Mais des problèmes d'interprétation existent sur l'âge qui n'a pas été validé. Leur croissance est lente. La comparaison des structures en taille avec des données historiques révèle une diminution de la taille de A. bairdii et de C. rupestris depuis 1989. Ces espèces ont une maturité tardive (14-16 ans) et une période de reproduction de 10-12 mois. H. dactylopterus a une maturité précoce (3-4 ans), les mâles maturent plus tôt, ils inséminent les femelles en automne, elles stockent les spermatozoïdes dans leurs ovaires et pondent au printemps. Ces espèces ont des fécondités annuelles indéterminées et des stratégies démographiques de type K. La flottille française profonde est composée de 50 bateaux débarquant par an 19000 t de poissons profonds. Les CPUE ont diminué depuis 1989. 8 espèces sont débarquées à 100%, 1 espèce est débarquée et rejetée : le grenadier avec un taux de rejet de 23%. 42 espèces sont rejetées à 100%. Les rejets représentent 52% du poids des captures et augmentent avec la profondeur. Les rejets totaux ont été estimés à 17500 t. Des estimations de stocks ont été réalisées sur A. bairdii et le grenadier donnant des valeurs indicatives. Les résultats doivent inciter à la prudence. Si la mise en place de quotas ne semble pas être envisageable, une réglementation serait l'utilisation d'engins de pêche plus sélectifs.
Author: Robin Eppe Publisher: ISBN: Category : Languages : fr Pages : 182
Book Description
En deçà du niveau taxonomique de l'espèce, la gestion du patrimoine piscicole dans une perspective de "conservation de la biodiversité" nécessite d'appréhender le fonctionnement de ses composantes populationnelles et évolutives en fonction des contraintes physiques inhérentes au réseau hydrographique et des réponses biologiques développées par les espèces, l'ensemble se traduisant directement en termes de structures génétiques et flux géniques. Ces relations ont été abordées par l'électrophorèse des protéines chez deux espèces d'eau vive aux stratégies biologiques contrastées, le chabot (Cottus gabio s.l.) et l'ombre commun (Thymallus thymallus). Le chabot présente de fréquentes fixations alléliques différentielles entre populations qui se traduisent par des distances de Nei intra bassin atteignant 0,22 dans un petit bassin comme celui de l'Hérault et de 0,43 dans celui de la Loire. Les distances inter bassins peuvent quant à elles dépasser 0,76. L'ombre commun, montre des distances près de deux fois moindres en inter bassin, et jusqu'à dix fois moindres en intra bassin (0,032 dans le bassin ligérien). À l'échelle du bassin, la variabilité intra population apparaît deux fois plus faible que la variabilité inter population chez le chabot (14,7% de la variabilité totale contre 30,1%), alors que la tendance inverse est observée chez l'ombre (37,4% contre 18%). Ces différences peuvent être reliées aux caractéristiques biologiques de ces espèces. Le chabot, beaucoup plus sédentaire et bien moins fécond, a une taille efficace de ses populations réduite d'autant, d'où une baisse de la diversité intra population et une divergence rapide des populations. En conséquence, alors que l'unité fonctionnelle et évolutive est de l'ordre du bassin hydrographique chez l'ombre commun, elle ne dépasse guère la rivière ou même le tronçon de rivière chez le chabot.
Author: Grégory Charrier
Author: Grégory Charrier
Author: Nicolas Pédron
Author: Charles Perrier
Author: 
Author: Mohamed Hichem Kara
Author: Valérie Allain
Author: Robin Eppe
Author: 
Author: Oscar Puebla
Author: