La spectrométrie de masse à ultrahaute résolution au service de la chimie des biomolécules PDF Download
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Book Description
Le spectromètre de masse hybride en tandem le LTQ-Orbitrap, dans lequel les ions sont détectés avec une grande précision en masse, a été utilisé dans les deux stratégies différentes de la métabolomique, c'est-à-dire l’approche globale et ciblée. Dans l’approche dite ciblée, il s’agit de mesurer la concentration de métabolites connus ou révélés par la transcriptomique ou la protéomique. Mais dès lors le problème majeur est la quantification absolue de ces métabolites, qui est généralement faite en LC/MS/MS en mode MRM (multiple réaction monitoring) dans les instruments hybrides de type spatiaux (exemple : triple quadripôle). Ce mode de balayage repose sur le suivi d’une voie de fragmentation du métabolite d’intérêt. La LC/FTMS ne nécessite pas de ciblé son analyse sur un seul ion précurseur. Elle permet le balayage sur toute une gamme de masse (de m/z), on propose ainsi une méthode de détection globale des masses basée sur la technologie Orbitrap . Dans l’approche globale, il s’agit de déterminer les flux métabolomiques dans un tissu ou fluide biologique en fonction de son environnement afin de déterminer des biomarqueurs. Bien que guidée par les statistiques, l’analyse de ces échantillons est complexe, aux vus du nombre de signaux détectés. La FTMS (Spectrométrie de Masse à Transformée de Fourrier), couplée généralement à la chromatographie liquide, permet d’avoir une unique composition élémentaire pour les métabolites de faibles masses moléculaires (inférieures à 500 u) permettant ainsi de faciliter l’identification des métabolites. Une alternative attrayante est l’injection directe automatisée (FIA) de l’échantillon complexe, mais elle entraine une perte d’information. Le but de ma thèse a été dès lors d’optimiser le traitement des données issu de FIA-FTMS et de quantifier la perte d’information inhérente à cette approche. Enfin, on utilise ce spectromètre pour l’étude de complexe non-covalent visant à caractériser l’interaction de complexes peptide-peptide et ADN-peptide. On observe une interaction non covalente très forte entre les résidus arginine et les groupements phosphate. Cette thèse montre le rôle joué par les formes zwitterioniques dans la stabilisation de tels complexes. Les mécanismes, expliquant les différentes voies de fragmentations, sont proposés et impliquent la formation de pont salin entre les espèces expliquant sa grande stabilité en phase gazeuse
Book Description
Le spectromètre de masse hybride en tandem le LTQ-Orbitrap, dans lequel les ions sont détectés avec une grande précision en masse, a été utilisé dans les deux stratégies différentes de la métabolomique, c'est-à-dire l’approche globale et ciblée. Dans l’approche dite ciblée, il s’agit de mesurer la concentration de métabolites connus ou révélés par la transcriptomique ou la protéomique. Mais dès lors le problème majeur est la quantification absolue de ces métabolites, qui est généralement faite en LC/MS/MS en mode MRM (multiple réaction monitoring) dans les instruments hybrides de type spatiaux (exemple : triple quadripôle). Ce mode de balayage repose sur le suivi d’une voie de fragmentation du métabolite d’intérêt. La LC/FTMS ne nécessite pas de ciblé son analyse sur un seul ion précurseur. Elle permet le balayage sur toute une gamme de masse (de m/z), on propose ainsi une méthode de détection globale des masses basée sur la technologie Orbitrap . Dans l’approche globale, il s’agit de déterminer les flux métabolomiques dans un tissu ou fluide biologique en fonction de son environnement afin de déterminer des biomarqueurs. Bien que guidée par les statistiques, l’analyse de ces échantillons est complexe, aux vus du nombre de signaux détectés. La FTMS (Spectrométrie de Masse à Transformée de Fourrier), couplée généralement à la chromatographie liquide, permet d’avoir une unique composition élémentaire pour les métabolites de faibles masses moléculaires (inférieures à 500 u) permettant ainsi de faciliter l’identification des métabolites. Une alternative attrayante est l’injection directe automatisée (FIA) de l’échantillon complexe, mais elle entraine une perte d’information. Le but de ma thèse a été dès lors d’optimiser le traitement des données issu de FIA-FTMS et de quantifier la perte d’information inhérente à cette approche. Enfin, on utilise ce spectromètre pour l’étude de complexe non-covalent visant à caractériser l’interaction de complexes peptide-peptide et ADN-peptide. On observe une interaction non covalente très forte entre les résidus arginine et les groupements phosphate. Cette thèse montre le rôle joué par les formes zwitterioniques dans la stabilisation de tels complexes. Les mécanismes, expliquant les différentes voies de fragmentations, sont proposés et impliquent la formation de pont salin entre les espèces expliquant sa grande stabilité en phase gazeuse
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Premier ouvrage spécifiquement consacré à ce couplage, La spectrométrie de masse en couplage avec la chromatographie en phase gazeuse se différencie des autres publications scientifiques dédiées à la spectrométrie de masse en abordant la technologie avec une réelle volonté didactique. Ce manuel propose une démarche ancrée dans la pratique et offre des atouts décisifs pour gagner en temps et en qualité : une approche simple et précise du principe de fonctionnement des spectromètres de masse utilisés en couplage GC-MS, avec un minimum d'équations mathématiques, un comparatif des différents types de sources, d'analyseurs et de détecteurs, une mise en avant des aspects pratiques tels que la stratégie de mise au point d'une méthode de dosage ou l'utilisation d'une bibliothèque de spectres, un inventaire des problèmes et des "pièges" habituellement rencontrés par les utilisateurs de couplage GC-MS, un recueil des erreurs les plus communément commises et les solutions claires pour s'en affranchir. Ces conseils sont illustrés par de nombreux exemples choisis dans des domaines aussi divers que la toxicologie ou l'analyse environnementale avec toujours un double objectif pour les utilisateurs : leur permettre de tirer rapidement le meilleur parti de leur spectromètre de masse, les assister dans la détermination du matériel et des méthodes les plus appropriés à un contexte analytique donné (identification structurale, dosages multi-résidus, détermination de composés à l'état de traces en matrices complexes, etc.).
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Un incident terroriste peut prendre une grande variété de formes. Les instruments de laboratoire, grâce à leur sensibilité et leur fiabilité sont essentiels pour des applications médico-légales et de sécurité. La variation d'abondance des isotopes naturels d’une molécule est liée aux précurseurs utilisés lors de sa synthèse. Ainsi, les variations d’abondances isotopiques sont utilisées afin de déterminer l’origine d’un explosif. Une méthode alternative à la spectrométrie de masse de ratios isotopiques a été développée (IRMS). Il s'agit d'une analyse directe sans utiliser de traitements chimiques et de séparations. Des échantillons de pentrite provenant de diverses origines ont été analysés à l'aide d'un spectromètre de masse à ultra-haute résolution (LTQ-Orbitrap). Après un attentat, des résidus sont présents à l'état de trace sur la scène de l'attaque. Ces particules sont des dépôts d'explosifs et/ou d'agents chimiques sur différents supports. La combinaison de méthodes de spectrométrie de masse et de procédés de désorption-ionisation (couplage Orbitrap et source DESI) permet l'analyse directe des échantillons, sans aucune préparation.
Author: Carter Litchfield Publisher: Elsevier ISBN: 0323153526 Category : Science Languages : en Pages : 374
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Analysis of Triglycerides is a 13-chapter text that covers the various types of analyses, the specific operating conditions, and experimental details necessary when dealing with certain types of triglyceride molecules and their derived diglycerides. After briefly providing an overview of the history and applications of triglycerides analysis, this book goes on describing the analytical techniques for triglyceride analysis, which are subdivided into sample preparation, molecular fractionation, and positional analysis. Considerable chapters are devoted to diglyceride characterization procedures. A chapter describes the various fatty acid distribution theories for estimating the composition of natural triglyceride mixtures. The final chapter outlines useful combinations of analytical techniques for obtaining maximum compositional information. This book is a comprehensive reference source for analytical and organic chemists and researchers, as well as for teachers and students who are interested in seeking more information on the subject.
Author: Bernard Valeur Publisher: Springer Science & Business Media ISBN: 364256853X Category : Science Languages : en Pages : 496
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This first volume in the new Springer Series on Fluorescence brings together fundamental and applied research from this highly interdisciplinary and field, ranging from chemistry and physics to biology and medicine. Special attention is given to supramolecular systems, sensor applications, confocal microscopy and protein-protein interactions. This carefully edited collection of articles is an invaluable tool for practitioners and novices.
Author: Publisher: Elsevier ISBN: 0128163968 Category : Science Languages : en Pages : 2444
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Comprehensive Foodomics, Three Volume Set offers a definitive collection of over 150 articles that provide researchers with innovative answers to crucial questions relating to food quality, safety and its vital and complex links to our health. Topics covered include transcriptomics, proteomics, metabolomics, genomics, green foodomics, epigenetics and noncoding RNA, food safety, food bioactivity and health, food quality and traceability, data treatment and systems biology. Logically structured into 10 focused sections, each article is authored by world leading scientists who cover the whole breadth of Omics and related technologies, including the latest advances and applications. By bringing all this information together in an easily navigable reference, food scientists and nutritionists in both academia and industry will find it the perfect, modern day compendium for frequent reference. List of sections and Section Editors: Genomics - Olivia McAuliffe, Dept of Food Biosciences, Moorepark, Fermoy, Co. Cork, Ireland Epigenetics & Noncoding RNA - Juan Cui, Department of Computer Science & Engineering, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE Transcriptomics - Robert Henry, Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation, The University of Queensland, St Lucia, Australia Proteomics - Jens Brockmeyer, Institute of Biochemistry and Technical Biochemistry, University Stuttgart, Germany Metabolomics - Philippe Schmitt-Kopplin, Research Unit Analytical BioGeoChemistry, Neuherberg, Germany Omics data treatment, System Biology and Foodomics - Carlos Leon Canseco, Visiting Professor, Biomedical Engineering, Universidad Carlos III de Madrid Green Foodomics - Elena Ibanez, Foodomics Lab, CIAL, CSIC, Madrid, Spain Food safety and Foodomics - Djuro Josic, Professor Medicine (Research) Warren Alpert Medical School, Brown University, Providence, RI, USA & Sandra Kraljevic Pavelic, University of Rijeka, Department of Biotechnology, Rijeka, Croatia Food Quality, Traceability and Foodomics - Daniel Cozzolino, Centre for Nutrition and Food Sciences, The University of Queensland, Queensland, Australia Food Bioactivity, Health and Foodomics - Miguel Herrero, Department of Bioactivity and Food Analysis, Foodomics Lab, CIAL, CSIC, Madrid, Spain Brings all relevant foodomics information together in one place, offering readers a ‘one-stop,’ comprehensive resource for access to a wealth of information Includes articles written by academics and practitioners from various fields and regions Provides an ideal resource for students, researchers and professionals who need to find relevant information quickly and easily Includes content from high quality authors from across the globe
Author: Claus Jacob Publisher: Springer ISBN: 9401789533 Category : Medical Languages : en Pages : 476
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Nature endows us with a treasure chest of Green Gold full of amazing ‘redox-active’ substances which interfere with numerous biological processes in our own body, in animals, bacteria, fungi and plants. Whilst such natural products are all around and also in us, we still do not fully understand how these compounds actually work. This book attempts to resolve some of the mysteries and riddles associated with such products. Written by more than thirty international experts from academia and industry, it places a focus on modern developments in this field and considers such natural products from various angles, from their isolation and characterization all along to product development and commercialization. Throughout, the reader will be confronted with modern approaches which enable the efficient identification and isolation of new natural products, help to elucidate their mode(s) of action and permit practical uses in Medicine, Cosmetics, Agriculture, Industry and as functional foods.
Author: Ahmed Belasri Publisher: Springer Nature ISBN: 9811554447 Category : Technology & Engineering Languages : en Pages : 659
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This book highlights peer reviewed articles from the 1st International Conference on Renewable Energy and Energy Conversion, ICREEC 2019, held at Oran in Algeria. It presents recent advances, brings together researchers and professionals in the area and presents a platform to exchange ideas and establish opportunities for a sustainable future. Topics covered in this proceedings, but not limited to, are photovoltaic systems, bioenergy, laser and plasma technology, fluid and flow for energy, software for energy and impact of energy on the environment.
Author: Tom Reynolds Publisher: CRC Press ISBN: 0203476344 Category : Health & Fitness Languages : en Pages : 414
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Aloes are a large genus of plants, about 450 species, from sub-Saharan Africa, Madagascar, and parts of Arabia. Many species are widespread in warm or tropical semi-arid regions, yet the distribution of others is limited to a few living in desert or wet mountainous regions. While some species have been adopted as medicinal plants since ancient time
Author: Ludovic Muller
Author: Ludovic Muller
Author: BOUCHONNET Stéphane
Author: Rusconi, Filippo
Author: Sigrid Baumgarten
Author: Carter Litchfield
Author: Bernard Valeur
Author: 
Author: Claus Jacob
Author: Ahmed Belasri
Author: Tom Reynolds