DEGRADATION BACTERIENNE DE LA MATIERE ORGANIQUE EN MILIEU MARIN PDF Download

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DEGRADATION BACTERIENNE DE LA MATIERE ORGANIQUE EN MILIEU MARIN

DEGRADATION BACTERIENNE DE LA MATIERE ORGANIQUE EN MILIEU MARIN PDF Author: FRANCOIS.. LAMY
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ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 163

Book Description
CE TRAVAIL A ETE REALISE DANS LE CADRE DU PROGRAMME JGOFS (JOINT GLOBAL FLUX STUDIES) DONT LE BUT EST DE DETERMINER SI L'OCEAN EST CAPABLE D'ABSORBER LE CO#2 PRODUIT PAR L'ACTIVITE HUMAINE. AU SEIN DE CETTE PROBLEMATIQUE, LES MODELES GLOBAUX SONT NECESSAIRES POUR QUANTIFIER LES FLUX DE CARBONE ENTRE L'ATMOSPHERE ET L'OCEAN, ET POUR ETUDIER LES NOMBREUX COUPLAGES ENTRE LES PROCESSUS PHYSIQUES, CHIMIQUES ET BIOLOGIQUES CONTROLANT CES FLUX. CEPENDANT, CES MODELES GLOBAUX NE SONT PAS ADAPTES POUR ETUDIER CHAQUE SOUS-SYSTEME DU SYSTEME OCEAN. EN PARTICULIER, LE SOUS-SYSTEME BACTERIEN, DONT LE ROLE EST PRIMORDIAL DANS LA SEQUESTRATION DU CARBONE PAR L'OCEAN ET LES SEDIMENTS, NECESSITE UN TRAVAIL SPECIFIQUE. LE BUT FINAL DE CETTE ETUDE EST DONC DE DEFINIR UN MODELE BACTERIEN QUI SERA INTEGRE DANS UN MODELE GLOBAL. POUR NOUS AFFRANCHIR DES COUPLAGES AVEC LA PHYSIQUE ET LES AUTRES SOUS-SYSTEMES BIOLOGIQUES, NOUS AVONS ETUDIE LES PROCESSUS BACTERIENS A PARTIR D'EXPERIENCES DE BIODEGRADATION EFFECTUEES SUR DES ECHANTILLONS D'EAU DE MER. DANS CE TRAVAIL, NOUS AVONS ADAPTE L'ASSIMILATION DE DONNEES A LA BIOLOGIE EXPERIMENTALE POUR DETERMINER LES PARAMETRES BACTERIENS ET CARACTERISER LA MATIERE ORGANIQUE PRESENTE DANS CHAQUE ECHANTILLON. DE PLUS, NOUS AVONS DEVELOPPE UNE DEMARCHE STATISTIQUE GLOBALE POUR ANALYSER ET COMPARER LES SOLUTIONS OBTENUES PAR ASSIMILATIONS. LA COMPARAISON DES SOLUTIONS OBTENUES A PARTIR D'UN ECHANTILLON PERMET DE DETECTER LES ERREURS LIEES AU MODELE, A UNE MAUVAISE INTERPRETATION DES MESURES, OU AU SOUS-ECHANTILLONNAGE. LA COMPARAISON DE SOLUTIONS OBTENUES A PARTIR D'ECHANTILLONS DIFFERENTS PERMET D'APPREHENDER LA VARIABILITE BIOLOGIQUE DES PARAMETRES BACTERIENS. CETTE DEMARCHE STATISTIQUE GLOBALE EST INDISPENSABLE POUR INTEGRER LES RESULTATS OBTENUS A PARTIR D'ECHANTILLONS DANS LE CADRE PLUS GLOBAL DE L'ETUDE DES CYCLES BIOGEOCHIMIQUES DANS L'OCEAN.

DEGRADATION BACTERIENNE DE LA MATIERE ORGANIQUE EN MILIEU MARIN

DEGRADATION BACTERIENNE DE LA MATIERE ORGANIQUE EN MILIEU MARIN PDF Author: FRANCOIS.. LAMY
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Languages : fr
Pages : 163

Book Description
CE TRAVAIL A ETE REALISE DANS LE CADRE DU PROGRAMME JGOFS (JOINT GLOBAL FLUX STUDIES) DONT LE BUT EST DE DETERMINER SI L'OCEAN EST CAPABLE D'ABSORBER LE CO#2 PRODUIT PAR L'ACTIVITE HUMAINE. AU SEIN DE CETTE PROBLEMATIQUE, LES MODELES GLOBAUX SONT NECESSAIRES POUR QUANTIFIER LES FLUX DE CARBONE ENTRE L'ATMOSPHERE ET L'OCEAN, ET POUR ETUDIER LES NOMBREUX COUPLAGES ENTRE LES PROCESSUS PHYSIQUES, CHIMIQUES ET BIOLOGIQUES CONTROLANT CES FLUX. CEPENDANT, CES MODELES GLOBAUX NE SONT PAS ADAPTES POUR ETUDIER CHAQUE SOUS-SYSTEME DU SYSTEME OCEAN. EN PARTICULIER, LE SOUS-SYSTEME BACTERIEN, DONT LE ROLE EST PRIMORDIAL DANS LA SEQUESTRATION DU CARBONE PAR L'OCEAN ET LES SEDIMENTS, NECESSITE UN TRAVAIL SPECIFIQUE. LE BUT FINAL DE CETTE ETUDE EST DONC DE DEFINIR UN MODELE BACTERIEN QUI SERA INTEGRE DANS UN MODELE GLOBAL. POUR NOUS AFFRANCHIR DES COUPLAGES AVEC LA PHYSIQUE ET LES AUTRES SOUS-SYSTEMES BIOLOGIQUES, NOUS AVONS ETUDIE LES PROCESSUS BACTERIENS A PARTIR D'EXPERIENCES DE BIODEGRADATION EFFECTUEES SUR DES ECHANTILLONS D'EAU DE MER. DANS CE TRAVAIL, NOUS AVONS ADAPTE L'ASSIMILATION DE DONNEES A LA BIOLOGIE EXPERIMENTALE POUR DETERMINER LES PARAMETRES BACTERIENS ET CARACTERISER LA MATIERE ORGANIQUE PRESENTE DANS CHAQUE ECHANTILLON. DE PLUS, NOUS AVONS DEVELOPPE UNE DEMARCHE STATISTIQUE GLOBALE POUR ANALYSER ET COMPARER LES SOLUTIONS OBTENUES PAR ASSIMILATIONS. LA COMPARAISON DES SOLUTIONS OBTENUES A PARTIR D'UN ECHANTILLON PERMET DE DETECTER LES ERREURS LIEES AU MODELE, A UNE MAUVAISE INTERPRETATION DES MESURES, OU AU SOUS-ECHANTILLONNAGE. LA COMPARAISON DE SOLUTIONS OBTENUES A PARTIR D'ECHANTILLONS DIFFERENTS PERMET D'APPREHENDER LA VARIABILITE BIOLOGIQUE DES PARAMETRES BACTERIENS. CETTE DEMARCHE STATISTIQUE GLOBALE EST INDISPENSABLE POUR INTEGRER LES RESULTATS OBTENUS A PARTIR D'ECHANTILLONS DANS LE CADRE PLUS GLOBAL DE L'ETUDE DES CYCLES BIOGEOCHIMIQUES DANS L'OCEAN.

Décomposition de la matière organique et flux de carbone à travers le compartiment bactérien en milieu marin

Décomposition de la matière organique et flux de carbone à travers le compartiment bactérien en milieu marin PDF Author: Séri Clément Yoro
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Category :
Languages : fr
Pages : 196

Book Description
CETTE ETUDE A POUR OBJECTIF PRINCIPAL DE QUANTIFIER ET DE MIEUX COMPRENDRE LES PROCESSUS MICROBIENS DE DEGRADATION ET DE REMINERALISATION DE LA MATIERE ORGANIQUE EN ETUDIANT, D'UNE PART, LES CONCENTRATIONS ET LES STOCKS DE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS (COD), ET D'AUTRE PART, EN PRECISANT LES CONSTANTES DE DECOMPOSITION DU COD, AINSI QUE LES RENDEMENTS DE CROISSANCE DES BACTERIES SUR CE POOL DE MATIERE. LES RESULTATS OBTENUS INDIQUENT QUE LES CONCENTRATIONS DE COD SONT PLUS ELEVEES EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE (65-118 M C) QUE DANS L'OCEAN AUSTRAL (31-60 M C). LE COUPLAGE ENTRE LES PROCESSUS AUTOTROPHES ET HETEROTROPHES, REPRESENTE PAR LE POURCENTAGE DE LA DEMANDE EN CARBONE DES BACTERIES PAR RAPPORT A LA PRODUCTION PRIMAIRE EST PLUS ELEVE EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE (50-123%) QUE DANS L'OCEAN AUSTRAL (14-47%). LES EXPERIENCES DE BIODEGRADATION ONT MIS EN EVIDENCE LE ROLE DES BACTERIES DANS LA DECOMPOSITION ET LE TRANSFERT DE LA MATIERE ORGANIQUE DE L'ETAT PARTICULAIRE VERS L'ETAT REELLEMENT DISSOUS VIA LA PHASE COLLOIDALE. LES GROSSES PARTICULES (> 60 M) ET LES PARTICULES DES PIEGES DERIVANTS PRELEVEES EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE SONT PLUS RAPIDEMENT DEGRADEES ET REMINERALISEES (0,25-0,61 J##1) PAR LES BACTERIES QUE CELLES PRELEVEES DANS L'OCEAN AUSTRAL (0,005-0,12 J##1), LES RENDEMENTS DE CROISSANCE DES BACTERIES DANS CES SITES ETANT PRATIQUEMENT SIMILAIRES (12-18%). LA SEPARATION DE LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE (MOD) EN DEUX CLASSES DE TAILLE PAR ULTRAFILTRATION TANGENTIELLE A L'AIDE D'UNE MEMBRANE EN POLYSULFONE DE POROSITE 1000 DALTONS ( 1 NM), NOUS A PERMIS D'ETUDIER LA REACTIVITE DES FRACTIONS COLLOIDALES (> 1000 DA) ET REELLEMENT DISSOUTES (

Dégradation microbienne de la matière organique à l'interface eau-sédiment en milieu marin

Dégradation microbienne de la matière organique à l'interface eau-sédiment en milieu marin PDF Author: Marie-Noëlle Hermin
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Languages : fr
Pages : 404

Book Description
DANS LE BUT DE L'ETUDE DE BIODEGRADATION DES MATIERES ORGANIQUES EN ZONE COTIERE, AU NIVEAU DE L'INTERFACE EAU-SEDIMENT, DES EXPERIENCES, D'UNE PART IN VITRO AVEC UNE INTERFACE ENRICHIE EN CELLULES BACTERIENNES RADIOACTIVES ET D'AUTRE PART EN MILIEU NATUREL AVEC UN ENRICHISSEMENT PAR DES PELOTES FECALES DE MOULES, ONT ETE MENEES. LA DYNAMIQUE DE POPULATIONS BACTERIENNES SE SUCCEDANT EST ETUDIE AINSI QUE LE METABOLISME ET L'ASSIMILATION D'ACIDES AMINES

LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE DES ZONES COTIERES

LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE DES ZONES COTIERES PDF Author: GAELLE.. DELIAT
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Languages : fr
Pages : 289

Book Description
LES ECOSYSTEMES COTIERS, INTERMEDIAIRES ENTRE TERRES ET OCEANS, SONT LE SIEGE DES PLUS GRANDES FLUCTUATIONS ASSOCIEES AU CYCLE DU CARBONE DU FAIT DES DIVERSES SOURCES DE MATIERE ORGANIQUE, EN PARTICULIER DISSOUTE (MOD), Y COEXISTANT. L'UN DES PROBLEMES MAJEURS ASSOCIES AU CALCUL DES FLUX DE CARBONE FLUVIAL A L'OCEAN REPOSE SUR L'INCERTITUDE CONCERNANT LES QUANTITES DE MOD MODIFIEE OU DECOMPOSEE DANS CES ENVIRONNEMENTS. L'OBJECTIF PRINCIPAL DE CETTE ETUDE ETAIT DONC D'APPORTER DES INFORMATIONS A LA FOIS QUALITATIVES ET QUANTITATIVES QUANT A LA DYNAMIQUE DE LA MOD EN ZONE COTIERE PAR EVALUATION DES STOCKS PRESENTS ET ESTIMATION DE LA CONTRIBUTION ET DU DEVENIR DES APPORTS ORGANIQUES ALLOCHTONES ET AUTOCHTONES, AFIN DE TENTER D'ETABLIR UN BILAN DES QUANTITES REELLES DE MOD APPORTEE PAR LES FLEUVES A L'OCEAN. L'ETUDE DE QUATRE SITES TRES DIVERSIFIES A PERMIS L'IDENTIFICATION DE DIFFERENTS MECANISMES INTERVENANT DANS LA PRODUCTION ET LA TRANSFORMATION DE LA MOD LORS DU MELANGE DES EAUX FLUVIALES ET MARINES. LA POTENTIALITE DE LA MOD FLUVIALE A SUBIR UNE DEGRADATION BACTERIENNE NE VARIE QUE PEU ENTRE LES SYSTEMES (DE 6 A 18%) MAIS SON TRANSFERT VERS L'OCEAN OUVERT DEPEND PRINCIPALEMENT DE LA CINETIQUE DE CETTE DEGRADATION ET DU TEMPS DE RESIDENCE DES MASSES D'EAU. ALORS QUE LA QUASI TOTALITE DU CARBONE DISSOUS BIODEGRADABLE DE L'ESCAUT PEUT ETRE TRANSFORMEE AU SEIN DE L'ESTUAIRE, LA DYNAMIQUE DES PANACHES DANUBIEN OU RHODANIEN ET DU LAGON SO DE NOUVELLE-CALEDONIE EST TROP VIVE POUR PERMETTRE UNE DEGRADATION IMPORTANTE. EN CONSEQUENCE, LES SOURCES CONTINENTALES S'AJOUTENT AU POOL DE MOD DISPONIBLE POUR LES BACTERIES SOIT DIRECTEMENT, SOIT INDIRECTEMENT APRES LE DECLIN DE LA PRODUCTION PRIMAIRE INDUITE EN ZONE COTIERE PAR L'APPORT DES NUTRIMENTS FLUVIAUX. CETTE PRODUCTION IN SITU DE MOD EST DEGRADABLE POUR 50 A 100%, MAIS DES ACCUMULATIONS PEUVENT SE PRODUIRE TRADUISANT UNE LIMITATION TRANSITOIRE DE LA CAPACITE BACTERIENNE A DEGRADER LA MOD DANS LES ZONES DE MELANGE.

Dynamique des populations bactériennes dans un marais maritime atlantique

Dynamique des populations bactériennes dans un marais maritime atlantique PDF Author: Cécile Crottereau
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Languages : fr
Pages : 217

Book Description
L'OBJECTIF DE CE TRAVAIL EST D'ETUDIER LES ACTIVITES PROTEASIQUES ET D'UPTAKE D'ACIDES AMINES DES POPULATIONS BACTERIENNES D'UN MARAIS MARITIME ATLANTIQUE ET D'ESTIMER LEUR CONTRIBUTION A LA PRODUCTION BACTERIENNE. DEUX APPROCHES ONT ETE UTILISEES : UN SUIVI DURANT UNE ANNEE D'UN MARAIS ET DES EXPERIENCES EN MICROCOSMES EFFECTUEES EN LABORATOIRE. AINSI, L'ETUDE DES ACTIVITES BACTERIENNES S'EST INSCRITE DANS LE CADRE D'UNE ETUDE PLUS GENERALE PERMETTANT D'APPREHENDER LA DYNAMIQUE DES POPULATIONS BACTERIENNES AU SEIN DE L'ECOSYSTEME DU MARAIS. DANS LE MARAIS, MALGRE UN APPORT EN NUTRIMENTS TRES IMPORTANT, LA PRODUCTION PRIMAIRE DU PHYTOPLANCTON EST ESSENTIELLEMENT REGENEREE. DE PLUS, L'ECOSYSTEME EST CARACTERISE PAR UN TAUX DE PERTE EN CARBONE TRES ELEVE. LES POPULATIONS BACTERIENNES SE DEVELOPPENT A PARTIR DE LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE ISSUE PAR VOIE DIRECTE DE L'EXCRETION DU PHYTOPLANCTON, OU PAR VOIE INDIRECTE DES PRODUITS DE DEGRADATION POST-MORTEM DES MICROALGUES. EN PERIODE HIVERNALE, L'ENRICHISSEMENT DU MILIEU EN MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE EST ESSENTIELLEMENT DU AUX PROCESSUS DE PERTE DU PHYTOPLANCTON (LYSE CELLULAIRE, BROUTAGE). EN PERIODE ESTIVALE, L'EXCRETION DEVIENT UNE SOURCE NON NEGLIGEABLE DE COMPOSES DISSOUS. LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE EST QUANTITATIVEMENT SUFFISANTE POUR SOUTENIR LA PRODUCTION BACTERIENNE ELEVEE MESUREE DANS LE BASSIN, MAIS UNE PARTIE DE CES COMPOSES SEMBLE INACCESSIBLE A LA DEGRADATION BACTERIENNE. LA PROTEOLYSE EST UNE SOURCE IMPORTANTE DE SUBSTRATS POUR LES BACTERIES ET CONTRIBUE A PRES DE 100% DE LA PRODUCTION BACTERIENNE. ELLE EST COUPLEE AVEC L'UPTAKE DES ACIDES AMINES NOTAMMENT PENDANT LA PERIODE ESTIVALE, LE METABOLISME BACTERIEN S'ADAPTANT AUX VARIATIONS DES SOURCES DE SUBSTRATS ACCESSIBLES POUR SA CROISSANCE. LA REGULATION DE LA SYNTHESE DES AMINOPEPTIDASES, JUSQUE LA MONTREE POUR DES CONCENTRATIONS EN SUBSTRATS TRES ELEVEES, EST VERIFIEE AUX CONCENTRATIONS NATURELLES MESUREES DANS LE MARAIS. AINSI, LA SYNTHESE DES ENZYMES EST PRINCIPALEMENT INHIBEE PAR LA QUANTITE D'ACIDES AMINES. UNE FOIS CETTE INHIBITION LEVEE, LE SYNTHESE EST ACTIVEE PAR LA CONCENTRATION EN PROTEINES DISSOUTES. DE PLUS, L'ESTIMATION DE L'HYDROLYSE IN SITU DES PROTEINES DISSOUTES S'AVERE ETRE COHERENTE AVEC L'ENSEMBLE DU METABOLISME BACTERIEN.

Modélisation du cycle de dégradation bactérienne de la matière organique. Application à la zone de turbidité maximale de l'estuaire de la Loire

Modélisation du cycle de dégradation bactérienne de la matière organique. Application à la zone de turbidité maximale de l'estuaire de la Loire PDF Author: Laurence Maurice
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Languages : fr
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Book Description
La zone de turbidité maximale de l'estuaire de la Loire est généralement soumise en période estivale à un important déficit en oxygène dissous qui peut atteindre l'anoxie en marée de vives eaux. Le modèle mathématique développé dans le cadre de cette étude estime la demande en oxygène sisssous induite par les processus d'oxydation de la matière organique et par la nitrification. Il repose sur deux compartiments biologiques majeurs, les biomasses bactériennes autotrophes et hétérotrophes ainsi que sur leurs sources énergétiques respectives, l'ammonium et la matière organique biodégradable. La matière organique est considérée non seulement sous sa fraction dissoute ou particulaire mais également en fonction de ses cinétiques de dégradation et de ses parts carbonée et azotée. Les paramètres cinétiques ont été calés sur des mesures en continu de respiration bactérienne. Les premiers résultats confirment l'importance du rôle de la crème de vase dans le déficit en oxygène du bouchon vaseux.

Réponse des bactéries marines au rayonnement ultraviolet-visible et aux modifications photochimiques de la matière organique dissoute

Réponse des bactéries marines au rayonnement ultraviolet-visible et aux modifications photochimiques de la matière organique dissoute PDF Author: Maher Abboudi
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Languages : en
Pages : 168

Book Description
In the marine environment, solar radiation can directly affect the activity of heterotrophic bacteria by causing various cellular damages or indirectly by modifying photochemically the dissolved organic matter (DOM). These various aspects were studied by determining experimentally the contribution of ultraviolet-B (UVR-B: 280-315 nm), ultraviolet-A (UVR-A: 315-400 nm) radiations as well as visible light (VIS: 400-700 nm) on DOM consumption by natural assemblages in various environments in the Northwestern Mediterranean Sea and by the marine bacterium, Vibrio angustum . We studied the effects of the photochemical transformations of DOM on the bacterial activity including production (BP), respiration (BR), bacterial growth efficiency (BGE) as well as the bacterial diversity, in two lagoons (Leucate and Canet) and in a coastal environment (Bay of Banyuls) in the Northwesternern Mediterranean Sea. These typical environments present large differences in the concentrations of total DOM and in colored DOM (CDOM). For the experiments, after filtration on 0,2 μm, samples were exposed during one day to the natural sunlight, then inoculated with the unexposed to light bacterial community of the same origin. The phototransformations of DOM lead to an increase of BP in the most eutrophic lagoon and to a decrease of in the mesotrophic one. These modifications of activity are associated with an increase of 120 % of the BGE in the coastal environment, and a decrease of 20-40 % in the lagoons. We also observed that the assimilation of DOM after sunlight exposure lead to modification in the structure of the total and active bacterial communities.The direct effects of the solar radiation on a natural assemblage lead to an increase of BP and BR in the column of water (from the surface until 10 m of depth) for various stations in the Mediterranean Sea. The inhibition of BP is essentially bound to UVR, and more important when the phytoplankton was eliminated from the sample, underlining the role of the phytoplanktonic excretions in the bacterial response to the UVR stress. Our results showed bacterial resilience induced by an increase of production during the night following the light exposure. The BR seems more durably affected by the solar radiation compared to BP. Generally, the solar radiation decreases the BCD and increases the BGE. The effects of the solar radiation seemed very limited in depth for the studied coastal stations, whereas the effects on BP seem measurable until depths of 8 m. These effects contrasted in the column of water were directly bound to the diffuse attenuation coefficient for downwelling UV irradiance of these various stations.To complete these data obtained in natural environment, physiological and morphological modifications of the bacterial strain Vibrio angustum were studied during growth under 4 light conditions (VIS+UVR-A+UVR-B, VIS+UVR-A, and darkness) by using a solar simulator in the laboratory. Our results suggest that the growth is severely inhibited by UVR-B and of a way moderated by UVR-A. The cells exposed to UVR-B present an important filamentation (size of cell: 42 μm with regard to the witness of size ~ 1,7 μm), with a reduced accumulation of damages DNA, and an absence of modifications in the composition in fatty acids, yet. These cells were able to recover a regular size after a darkness phase. The cells exposed to VIS and VIS UVR-A presented an important change of the fluorescence very likey in relation to the DNA modification of the topology of the genome.

LE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS EN MILIEU MARIN

LE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS EN MILIEU MARIN PDF Author: BERNARD.. AVRIL
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Languages : fr
Pages : 323

Book Description
LA DISTRIBUTION ET LA DYNAMIQUE DU CARBONE ORGANIQUE DISSOUS, ANALYSE PAR UNE METHODE D'OXYDATION CATALYTIQUE HAUTE TEMPERATURE, SONT DECRITES ET DISCUTEES POUR TROIS ZONES TYPIQUES DE L'OCEAN, A DIFFERENTES ECHELLES DE TEMPS CARACTERISTIQUES. IL EST MONTRE QUE LE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS EST LE VECTEUR MAJEUR D'EVACUATION DES MATIERES SYNTHETISEES EN SURFACE VERS LES EAUX PROFONDES. SA PARTICIPATION A LA FONCTION-PUITS DE L'OCEAN VIS-A-VIS DU CYCLE BIOGEOCHIMIQUE GLOBAL DU CARBONE EST AINSI DEMONTREE ET QUANTIFIEE DANS DIVERS TYPES D'ECOSYSTEMES OCEANIQUES. DES ETUDES IN VITRO PERMETTENT EGALEMENT D'IDENTIFIER ET DE QUANTIFIER LES ROLES PHYSIOLOGIQUES ET ECOLOGIQUES DU CARBONE ORGANIQUE DISSOUS DANS DES MICROCOSMES SIMPLIFIES DE PRODUCTION ET DE DEGRADATION DE LA MATIERE ORGANIQUE MARINE. IL EST MONTRE QUE LE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS EST UN RESERVOIR TAMPON ET INTERMEDIAIRE, DONT LA FRACTION LABILE EST LARGEMENT, RAPIDEMENT ET PREFERENTIELLEMENT MISE EN JEU PAR RAPPORT AU CARBONE ORGANIQUE PARTICULAIRE

Effet de la pression hydrostatique sur la distribution et l'activité (bioluminescence, dégradation de la matière organique) de différents micro-organismes marins

Effet de la pression hydrostatique sur la distribution et l'activité (bioluminescence, dégradation de la matière organique) de différents micro-organismes marins PDF Author: Badr Al Ali
Publisher:
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Languages : fr
Pages : 214

Book Description
Le travail réalisé dans le cadre de cette thèse a pour but de fournir de nouvelles approches méthodologiques pour caractériser les communautés microbiennes en milieu océanique profond et de mesurer leurs activités. Dans le cadre de cette thèse, nous avons tout d'abord amélioré une technique d'hybridation in situ (CARD-FISH) pour dénombrer les groupes phylogénétiques majeurs en milieu marin profond. En Mer Tyrrhénienne, le pourcentage des Bacteria est toujours plus élevé que celui des Crenarchaea et des Euryarchaea. Alors que le pourcentage des Crenarchaea augmente avec la profondeur, celui des Euryarchaea est relativement homogène le long de la colonne d’eau. Dans le cadre d'une collaboration avec le Centre de Physique des Particules de Marseille sur le programme ANTARES (télescope sous-marin à neutrino), nous avons étudié quel pouvait être le rôle des bactéries luminescentes dans le bruit lumineux détecté quelquefois par le télescope. Une première étape a été de développer une approche quantitative par la méthode CARD-FISH sur les ARNm des gènes lux qui n'a été qu'en partie concluante mais donne des résultats préliminaires encourageants. Notre attention s'est portée sur l'identification puis la caractérisation d'une souche isolée à 2200 m de profondeur à proximité du site ANTARES (nommée Photobacterium phosphoreum ANT-2200). Pour mieux comprendre le rôle des bactéries bioluminescentes en milieu profond, nous avons développé un système hyperbare spécifique pour évaluer l’effet de la pression hydrostatique sur cette souche. Alors que cette souche a été caractérisée comme piezotolérante (croissance non sensible à des variations de pression), la lumière produite est plus élevée à la pression de 22 MPa (2200 m simulée) qu'à 0.1 MPa (pression atmosphérique). Enfin, une étude complémentaire m'a conduit à étudier l'effet de la pression hydrostatique sur une souche hydrocarbonoclaste Marinobacter aquaeolei #5. Là encore, nous montrons que la modification de la pression hydrostatique n’influence pas le taux de croissance (souche piezotolérante), mais peut fortement modifier les voies métaboliques, notamment la quantité et la nature des cires produites. Les cires intracellulaires s’accumulent sous formes de corps lipidiques avec une proportion moins importante à 35 MPa alors que le rapport d'insaturation des acides gras membranaires et la quantité de cires di-insaturées augmentent à la pression 35 MPa. Par ces études, nous suggérons que la pression hydrostatique joue un rôle important au niveau de la physiologie des bactéries marines et la distribution des procaryotes dans les écosystèmes marins profonds.

Biogéochimie de la matière organique à l'interface eau-sédiment marin

Biogéochimie de la matière organique à l'interface eau-sédiment marin PDF Author: R. Daumas
Publisher:
ISBN: 9782222026389
Category : Biogeochemistry
Languages : en
Pages : 336

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