Décomposition de la matière organique et flux de carbone à travers le compartiment bactérien en milieu marin PDF Download
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CETTE ETUDE A POUR OBJECTIF PRINCIPAL DE QUANTIFIER ET DE MIEUX COMPRENDRE LES PROCESSUS MICROBIENS DE DEGRADATION ET DE REMINERALISATION DE LA MATIERE ORGANIQUE EN ETUDIANT, D'UNE PART, LES CONCENTRATIONS ET LES STOCKS DE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS (COD), ET D'AUTRE PART, EN PRECISANT LES CONSTANTES DE DECOMPOSITION DU COD, AINSI QUE LES RENDEMENTS DE CROISSANCE DES BACTERIES SUR CE POOL DE MATIERE. LES RESULTATS OBTENUS INDIQUENT QUE LES CONCENTRATIONS DE COD SONT PLUS ELEVEES EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE (65-118 M C) QUE DANS L'OCEAN AUSTRAL (31-60 M C). LE COUPLAGE ENTRE LES PROCESSUS AUTOTROPHES ET HETEROTROPHES, REPRESENTE PAR LE POURCENTAGE DE LA DEMANDE EN CARBONE DES BACTERIES PAR RAPPORT A LA PRODUCTION PRIMAIRE EST PLUS ELEVE EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE (50-123%) QUE DANS L'OCEAN AUSTRAL (14-47%). LES EXPERIENCES DE BIODEGRADATION ONT MIS EN EVIDENCE LE ROLE DES BACTERIES DANS LA DECOMPOSITION ET LE TRANSFERT DE LA MATIERE ORGANIQUE DE L'ETAT PARTICULAIRE VERS L'ETAT REELLEMENT DISSOUS VIA LA PHASE COLLOIDALE. LES GROSSES PARTICULES (> 60 M) ET LES PARTICULES DES PIEGES DERIVANTS PRELEVEES EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE SONT PLUS RAPIDEMENT DEGRADEES ET REMINERALISEES (0,25-0,61 J##1) PAR LES BACTERIES QUE CELLES PRELEVEES DANS L'OCEAN AUSTRAL (0,005-0,12 J##1), LES RENDEMENTS DE CROISSANCE DES BACTERIES DANS CES SITES ETANT PRATIQUEMENT SIMILAIRES (12-18%). LA SEPARATION DE LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE (MOD) EN DEUX CLASSES DE TAILLE PAR ULTRAFILTRATION TANGENTIELLE A L'AIDE D'UNE MEMBRANE EN POLYSULFONE DE POROSITE 1000 DALTONS ( 1 NM), NOUS A PERMIS D'ETUDIER LA REACTIVITE DES FRACTIONS COLLOIDALES (> 1000 DA) ET REELLEMENT DISSOUTES (
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CETTE ETUDE A POUR OBJECTIF PRINCIPAL DE QUANTIFIER ET DE MIEUX COMPRENDRE LES PROCESSUS MICROBIENS DE DEGRADATION ET DE REMINERALISATION DE LA MATIERE ORGANIQUE EN ETUDIANT, D'UNE PART, LES CONCENTRATIONS ET LES STOCKS DE CARBONE ORGANIQUE DISSOUS (COD), ET D'AUTRE PART, EN PRECISANT LES CONSTANTES DE DECOMPOSITION DU COD, AINSI QUE LES RENDEMENTS DE CROISSANCE DES BACTERIES SUR CE POOL DE MATIERE. LES RESULTATS OBTENUS INDIQUENT QUE LES CONCENTRATIONS DE COD SONT PLUS ELEVEES EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE (65-118 M C) QUE DANS L'OCEAN AUSTRAL (31-60 M C). LE COUPLAGE ENTRE LES PROCESSUS AUTOTROPHES ET HETEROTROPHES, REPRESENTE PAR LE POURCENTAGE DE LA DEMANDE EN CARBONE DES BACTERIES PAR RAPPORT A LA PRODUCTION PRIMAIRE EST PLUS ELEVE EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE (50-123%) QUE DANS L'OCEAN AUSTRAL (14-47%). LES EXPERIENCES DE BIODEGRADATION ONT MIS EN EVIDENCE LE ROLE DES BACTERIES DANS LA DECOMPOSITION ET LE TRANSFERT DE LA MATIERE ORGANIQUE DE L'ETAT PARTICULAIRE VERS L'ETAT REELLEMENT DISSOUS VIA LA PHASE COLLOIDALE. LES GROSSES PARTICULES (> 60 M) ET LES PARTICULES DES PIEGES DERIVANTS PRELEVEES EN MEDITERRANEE NORD-OCCIDENTALE SONT PLUS RAPIDEMENT DEGRADEES ET REMINERALISEES (0,25-0,61 J##1) PAR LES BACTERIES QUE CELLES PRELEVEES DANS L'OCEAN AUSTRAL (0,005-0,12 J##1), LES RENDEMENTS DE CROISSANCE DES BACTERIES DANS CES SITES ETANT PRATIQUEMENT SIMILAIRES (12-18%). LA SEPARATION DE LA MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE (MOD) EN DEUX CLASSES DE TAILLE PAR ULTRAFILTRATION TANGENTIELLE A L'AIDE D'UNE MEMBRANE EN POLYSULFONE DE POROSITE 1000 DALTONS ( 1 NM), NOUS A PERMIS D'ETUDIER LA REACTIVITE DES FRACTIONS COLLOIDALES (> 1000 DA) ET REELLEMENT DISSOUTES (
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CE TRAVAIL A ETE REALISE DANS LE CADRE DU PROGRAMME JGOFS (JOINT GLOBAL FLUX STUDIES) DONT LE BUT EST DE DETERMINER SI L'OCEAN EST CAPABLE D'ABSORBER LE CO#2 PRODUIT PAR L'ACTIVITE HUMAINE. AU SEIN DE CETTE PROBLEMATIQUE, LES MODELES GLOBAUX SONT NECESSAIRES POUR QUANTIFIER LES FLUX DE CARBONE ENTRE L'ATMOSPHERE ET L'OCEAN, ET POUR ETUDIER LES NOMBREUX COUPLAGES ENTRE LES PROCESSUS PHYSIQUES, CHIMIQUES ET BIOLOGIQUES CONTROLANT CES FLUX. CEPENDANT, CES MODELES GLOBAUX NE SONT PAS ADAPTES POUR ETUDIER CHAQUE SOUS-SYSTEME DU SYSTEME OCEAN. EN PARTICULIER, LE SOUS-SYSTEME BACTERIEN, DONT LE ROLE EST PRIMORDIAL DANS LA SEQUESTRATION DU CARBONE PAR L'OCEAN ET LES SEDIMENTS, NECESSITE UN TRAVAIL SPECIFIQUE. LE BUT FINAL DE CETTE ETUDE EST DONC DE DEFINIR UN MODELE BACTERIEN QUI SERA INTEGRE DANS UN MODELE GLOBAL. POUR NOUS AFFRANCHIR DES COUPLAGES AVEC LA PHYSIQUE ET LES AUTRES SOUS-SYSTEMES BIOLOGIQUES, NOUS AVONS ETUDIE LES PROCESSUS BACTERIENS A PARTIR D'EXPERIENCES DE BIODEGRADATION EFFECTUEES SUR DES ECHANTILLONS D'EAU DE MER. DANS CE TRAVAIL, NOUS AVONS ADAPTE L'ASSIMILATION DE DONNEES A LA BIOLOGIE EXPERIMENTALE POUR DETERMINER LES PARAMETRES BACTERIENS ET CARACTERISER LA MATIERE ORGANIQUE PRESENTE DANS CHAQUE ECHANTILLON. DE PLUS, NOUS AVONS DEVELOPPE UNE DEMARCHE STATISTIQUE GLOBALE POUR ANALYSER ET COMPARER LES SOLUTIONS OBTENUES PAR ASSIMILATIONS. LA COMPARAISON DES SOLUTIONS OBTENUES A PARTIR D'UN ECHANTILLON PERMET DE DETECTER LES ERREURS LIEES AU MODELE, A UNE MAUVAISE INTERPRETATION DES MESURES, OU AU SOUS-ECHANTILLONNAGE. LA COMPARAISON DE SOLUTIONS OBTENUES A PARTIR D'ECHANTILLONS DIFFERENTS PERMET D'APPREHENDER LA VARIABILITE BIOLOGIQUE DES PARAMETRES BACTERIENS. CETTE DEMARCHE STATISTIQUE GLOBALE EST INDISPENSABLE POUR INTEGRER LES RESULTATS OBTENUS A PARTIR D'ECHANTILLONS DANS LE CADRE PLUS GLOBAL DE L'ETUDE DES CYCLES BIOGEOCHIMIQUES DANS L'OCEAN.
Author: Bernard Avril Publisher: ISBN: Category : Languages : fr Pages : 0
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La distribution et la dynamique du carbone organique dissous, analyse par une methode d'oxydation catalytique haute temperature, sont decrites et discutees pour trois zones typiques de l'ocean, a differentes echelles de temps caracteristiques. Il est montre que le carbone organique dissous est le vecteur majeur d'evacuation des matieres synthetisees en surface vers les eaux profondes. Sa participation a la fonction-puits de l'ocean vis-a-vis du cycle biogeochimique global du carbone est ainsi demontree et quantifiee dans divers types d'ecosystemes oceaniques. Des etudes in vitro permettent egalement d'identifier et de quantifier les roles physiologiques et ecologiques du carbone organique dissous dans des microcosmes simplifies de production et de degradation de la matiere organique marine. Il est montre que le carbone organique dissous est un reservoir tampon et intermediaire, dont la fraction labile est largement, rapidement et preferentiellement mise en jeu par rapport au carbone organique particulaire
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La contribution des bactéries hétérotrophes à la dynamique du carbone organique dans la zone pélagique des lacs a été étudiée dans cinq lacs profonds européens. La biomasse bactérienne est comparée à l'ensemble des formes dissoutes (biodégradable/réfractaire) et particulaires du carbone organique au cours de plusieurs cycles annuels. La production bactérienne peut égaler, voire dépasser la production primaire. La forte pression de prédation des flagellés, mesurée dans notre étude, montre que les bactéries jouent un rôle important en terme de lien vers les étages trophiques supérieurs. Une attention particulière a été portée à la mesure de la respiration bactérienne sur les stocks de matières organiques : une méthode de mesure de production de CO2 a été développée. L'activité métabolique des bactéries (production de CO2, quotient respiratoire) semble traduire les contraintes physiques (stratification) et trophiques (origine allochtone/autochtone des apports) subies par le système. La médiane de l'efficacité de production de biomasse est de 5 % (10 % en moyenne). La valeur de 50 % souvent admise dans la bibliographie conduit à une sous-estimation des flux de carbone transitant par le compartiment bactérien. Une étude préliminaire de la distribution spatio-temporelle de la composition spécifique des communautés bactériennes, évaluée par une technique moléculaire (FISH), est présentée. Elle montre que les changements de dominance constatés sont probablement liés à des modifications qualitatives des apports trophiques. Sur un plan général, l'ensemble des résultats montre l'intérêt de na pas considérer l'activité bactérienne uniquement à travers la production de biomasse. La mesure directe de la production de CO2, notamment, apparaît incontournable pour l'étude de l'interface matières organiques - bactéries. La pertinence des descripteurs bactériens dans l'évaluation du niveau trophique des milieux lacustres et dans l'étude de leur évolution, est discutée.
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DANS LE BUT DE L'ETUDE DE BIODEGRADATION DES MATIERES ORGANIQUES EN ZONE COTIERE, AU NIVEAU DE L'INTERFACE EAU-SEDIMENT, DES EXPERIENCES, D'UNE PART IN VITRO AVEC UNE INTERFACE ENRICHIE EN CELLULES BACTERIENNES RADIOACTIVES ET D'AUTRE PART EN MILIEU NATUREL AVEC UN ENRICHISSEMENT PAR DES PELOTES FECALES DE MOULES, ONT ETE MENEES. LA DYNAMIQUE DE POPULATIONS BACTERIENNES SE SUCCEDANT EST ETUDIE AINSI QUE LE METABOLISME ET L'ASSIMILATION D'ACIDES AMINES
Author: Nadja Maria Lins da Silva Publisher: ISBN: Category : Languages : fr Pages : 238
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Les cycles saisonniers des peuplements microbiens planctoniques et des particules détritiques de la mer Ligure (Méditerranée nord-occidentale) ont été étudiés à l'entrée de la rade de Villefranche-sur-Mer (station côtière, point "B":7°15'0"E ; 43°41'10"N) et pour 6 stations choisies sur la radiale Nice-Calvi (de 3 a 28 milles de distance à la côte, traversant le front de la mer Ligure. Le but de ce travail a été de décrire les variations spatio-temporelles de la contribution des microorganismes auto- et hétérotrophes au "pool" du carbone organique total en action dans les zones étudiées. L'ensemble de ces résultats montre les caractéristiques oligotrophes du bassin liguro-provencal : exprimé en carbone, les niveaux de biomasses particulaires totales sont souvent en dessous de 100 ugc/l ; tout au long de l'année et aussi bien à la côte qu'au large, la communauté microbienne se trouvant en dessous de 5um environ représente plus de 60% du carbone organique particulaire total ; la production primaire est dominée par les nanoflagelles et les cyanobactéries, et semble être liée a une régénération des sels nutritifs via un flux élevé de carbone vers le compartiment bactérien et un recyclage de matière organique dans la couche de surface ; les bactéries planctoniques et les microprotozoaires constituent une fraction significative de la matière organique dans la couche de surface ; les bactéries planctoniques et les microprotozoaires constituent une fraction significative de la matière particulaire totale.
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CE TRAVAIL A POUR BUT L'AMELIORATION DES CONNAISSANCES ENCORE FRAGMENTAIRES DES INTERACTIONS ENTRE LES FRACTIONS BACTERIENNES, LES PARTICULES ET LEUR MILIEU ENVIRONNANT, PERMETTANT AINSI UNE MEILLEURE COMPREHENSION DU DEVENIR DE LA MATIERE ORGANIQUE VIA LA BOUCLE BACTERIENNE. L'APPROCHE EXPERIMENTALE, TOUT D'ABORD, AVEC LA MISE AU POINT D'UNE METHODE DE MESURE DE L'ACTIVITE RESPIRATOIRE BACTERIENNE PAR CYTOMETRIE EN FLUX, PUIS LES ANALYSES SUR DIFFERENTS TYPES D'ESTUAIRES, NOUS ONT PERMIS D'ABORDER LES PROCESSUS DE FACON GLOBALE. NOUS AVONS MONTRE QUE LA PRESENCE DE PARTICULES AVAIT UNE INFLUENCE SUR LE COMPORTEMENT BACTERIEN, EN AUGMENTANT L'ACTIVITE RESPIRATOIRE DES CELLULES. LES PARAMETRES PHYSICOCHIMIQUES TELS QUE LA SALINITE N'ONT QU'UNE INFLUENCE PONCTUELLE ET REVERSIBLE SUR L'ADHESION BACTERIENNE. LA DISTRIBUTION BACTERIENNE REPOSE AVANT TOUT SUR LA REPARTITION DE LA MATIERE ORGANIQUE ENTRE LES PARTICULES ET LE MILIEU ENVIRONNANT. ELLE EST DONC LIEE A LA PRODUCTION PRIMAIRE ET ON CONSTATE DES VARIATIONS DE LA DISTRIBUTION BACTERIENNE EN RAPPORT AVEC LES ZONES DE FRONTS (HALOCLINE), OU LA PRODUCTION EST PRIVILEGIEE, ET LES VARIATIONS TEMPORELLES (SAISONNIERES OU JOURNALIERES). L'ACTIVITE DES BACTERIES IMMOBILISEES EST, DANS LA PLUPART DES CAS ETUDIES, RESPONSABLE DE LA CONSOMMATION D'OXYGENE ET DONC DE LA DEGRADATION DE LA MATIERE ORGANIQUE. MAIS LES BACTERIES LIEES, SONT, DANS CERTAINS MILIEUX SOUVENT CARACTERISES PAR LEUR RICHESSE EN MATIERE ORGANIQUE DISSOUTE, MOINS ACTIVES QUE LES BACTERIES LIBRES. EN REALITE, IL EXISTE UN SYSTEME EN EQUILIBRE ENTRE LA DISTRIBUTION DE L'ACTIVITE ET LA REPARTITION DE LA MATIERE ORGANIQUE, AVEC DES FEED-BACK BACTERIENS SUIVIS DE FEED-BACK DU MILIEU EN EVOLUTION. ON A DONC BIEN DES INTERACTIONS ENTRE LE MILIEU, LES PARTICULES ET LES BACTERIES QUI DETERMINENT LA NATURE ET L'IMPORTANCE DES FLUX DE MATIERES ORGANIQUES
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"Un panorama des dernières connaissances sur les axes majeurs de recherche en microbiologie marine". Quatre grandes parties : Concepts généraux et méthodologiques - Intervention des bactéries dans les flux de matière et d'énergie - Les écosystèmes particuliers - Bactéries et virus du domaine marin et activités humaines. [SDM].
Author: Séri Clément Yoro
Author: Séri Clément Yoro
Author: FRANCOIS.. LAMY
Author: Bernard Avril
Author: Rene Quinton
Author: Sylvie Viboud
Author: Marie-Noëlle Hermin
Author: Nadja Maria Lins da Silva
Author: Muriel Lepesteur
Author: Micheline Bianchi
Author: RENE. QUINTON