Author: Viviane PlazanetPublisher:
ISBN:
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Languages : fr
Pages : 84
Book Description
Contribution à l'étude du mécanisme de l'extinction de la fluorescence dans les solutions organiques
Author: Viviane PlazanetContribution à l'étude de la fluorescence des vapeurs organiques
Author: Blanche RingÉtude théorique de l'extinction de fluorescence des protéines fluorescentes
Author: Gabriella JonassonPublisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 0
Book Description
Les protéines fluorescentes, comme la GFP (green fluorescent protein), sont des protéines naturellement fluorescentes qui sont utilisées pour leur rôle de marqueur, permettant de localiser des protéines dans les cellules et d'en suivre les déplacements. De nombreuses études expérimentales et théoriques ont été menées ces dix dernières années sur les protéines fluorescentes. De là, se forge une compréhension essentiellement qualitative du rôle de la protéine vis-à-vis de l'obtention ou non d'une émission radiative : il apparaît que la protéine permet la fluorescence en bloquant les processus qui la désactivent ; ces processus de désactivation sont très rapides et efficaces (à l'échelle de la picoseconde) dans le cas du chromophore seul, et ils sont bien identifiés comme étant des torsions autour des liaisons intercycles (tau et phi). Dans la protéine, la sensibilité des temps de vie de fluorescence à des mutations proches ou non du chromophore, à des modifications de pH ou de température laisse supposer un contrôle de la dynamique du chromophore par différents paramètres, sans qu'ils soient pour autant identifiés et mis en relation.Une étude de la dynamique de la protéine permettrait de faire la lumière sur les mécanismes responsables de ces phénomènes photophysiques pour lesquels une analyse structurale ne suffit pas. Cependant l'étude de la dynamique est limitée par la taille du système (>30 000 atomes), par l'échelle de temps des phénomènes photophysiques considérés (dizaine de nanosecondes) et par le fait que les deux torsions tau et phi sont fortement couplées dans l'état excité du chromophore. Ces trois facteurs excluent les méthodes de dynamique existantes aujourd'hui ; dynamique quantique (AIMD), dynamique mixte classique-quantique (QM/MD) et dynamique moléculaire classique (MD).Nous avons surmonté le problème par la modélisation de la surface d'énergie potentielle de torsion du chromophore à l'état excité basée sur des calculs quantiques de haute précision, par une interpolation des valeurs obtenues par une expression analytique appropriée en fonction des angles de torsion tau et phi et avec une précision suffisante pour reproduire des barrières de l'ordre de la kcal/mol, et enfin, par l'implémentation de cette expression analytique dans le programme parallèle AMBER. Une deuxième difficulté théorique concerne la simulation et l'analyse statistique d'événements peu fréquents à l'échelle de la nanoseconde, et dont on ne connait pas le chemin de réaction, ici les déformations de la protéine et du chromophore conduisant aux géométries favorables à la conversion interne. Grâce à ces développements et aux simulations qu'ils ont permises, nous avons réalisé la première modélisation de la désactivation non-radiative par conversion interne à l'échelle de la nanoseconde dans trois protéines fluorescentes différentes. L'analyse des dynamiques moléculaires classiques nous donne une évaluation quantitative des temps de vie de l'extinction de fluorescence, en accord avec les données expérimentales. Par ailleurs elle nous a permis d'identifier les mouvements moléculaires concertés de la protéine et du chromophore conduisant à cette extinction. De ces résultats, émerge une représentation plus complète du mécanisme qui libère la torsion du chromophore ou qui la déclenche : il peut venir d'un mouvement spécifique de la protéine, qui se produit à l'échelle de la nanoseconde, ou bien de plusieurs mouvements spécifiques, plus fréquents (rupture de liaisons hydrogène, rotation de chaînes latérales, dynamique d'agrégats d'eau), mais qui coïncident seulement à l'échelle de la nanoseconde. Ces mouvements spécifiques n'ont pas un coût énergétique important mais la nécessité de leur coïncidence crée un délai de l'ordre de quelques nanosecondes alors que dans le vide la torsion se produit en quelques picosecondes. Dans le cas des protéines étudiées, on a identifié en grande partie les mécanismes et les acides aminés qui sont impliqués.
Contribution à l'étude des fluorescences de longue durée de molécules aromatiques en solution organique rigide à 77° K en relation avec les mécanismes de la photoionisation et l'état de dispersion des molécules de soluté
Author: Marc EwaldInvitation à la fluorescence moléculaire
Author: Bernard ValeurPublisher: De Boeck Supérieur
ISBN: 9782804145972
Category : Science
Languages : fr
Pages : 216
Book Description
L’étude de la fluorescence moléculaire donne lieu à d’importants outils d'investigation dans de très nombreux domaines : la chimie et la physicochimie (polymères, matériaux, colloïdes, etc.), la biochimie, la biologie, la recherche biomédicale et l’industrie pharmaceutique. Mais sur quoi repose le succès de cette approche ? D’une part, sur la haute sensibilité des techniques fluorimétriques, capables de détecter une molécule unique. D’autre part, sur la spécificité de la réponse de certaines molécules fluorescentes – les sondes – à leur microenvironnement. Ces sondes donnent accès à la dynamique des phénomènes rapides et/ou aux paramètres structuraux du système étudié à des échelles de temps de l'ordre de la durée de vie de leur état excité (quelques nanosecondes). En mettant à profit les techniques modernes de microscopie, la fluorescence moléculaire offre également des possibilités remarquables de résolution spatiale pour observer en temps réel des échantillons intacts, en particulier des systèmes biologiques. Ce livre d’introduction à la fluorescence moléculaire se destine à tout étudiant, doctorant, chercheur, technicien et ingénieur devant s’initier rapidement à cette technique dans le but de l’appliquer rigoureusement à un problème concret relevant des sciences physiques, chimiques, biologiques et médicales.
CONTRIBUTION A L'ETUDE DE LA FLUORESCENCE RETARDEE DES CRISTAUX ORGANIQUES
Author: PHILIPPE.. PEEContribution à l'étude des fluorescences de longue durée de molécules aromatiques en solution organique rigide à 77K̊ en relations avec les mécanismes de la photoionisation et l'état de dispersion des molécules du soluté
Author: Marc EwaldContribution à l'étude de la fluorescence retardée des composés aromatiques en solution
Author: François DupuyContribution à l'étude de la fluorescence des solutions ...
Author: Jean BouchardCONTRIBUTION A L'ETUDE DE LA FLUORESCENCE RETARDEE DES COMPOSES AROMATIQUES EN SOLUTION LIQUIDE DE FAIBLE VISCOSITE
Author: Jean-François BénézechPublisher:
ISBN:
Category :
Languages : fr
Pages : 70
Book Description